一篇发表在Cell子刊Immunity杂志(IF:22.5)的文章“Single-cell sequencing of peripheral blood mononuclear cells revealsdistinct immune response landscapes of COVID-19 and influenza patients”,使用华大智造单细胞测序平台开展对新冠和流感的相关研究,成功揭示了COVID-19 和流感患者的不同免疫应答情况。
研究背景
2019年至今,新冠和甲流的双重入侵对我们的生命安全一直存在着严重威胁,因此开展对新冠和流感的相关研究已迫在眉睫。目前,虽然关于临床数据血细胞指标检测的越来越多,但其潜在的分子机制尚未得到澄清。
研究方法
本研究对新冠COVID-19患者的外周血单个核细胞(PBMCs)的转录组动态进行深入研究,并将IAV甲流(IAV)患者和对照组、健康供体的图谱进行了比较。通过将单细胞RNA测序(scRNA-seq)与临床症状相结合,揭示这些感染的特征。
主要结果
1.COVID-19和IAV患者外周血单个核细胞的单细胞转录景观
为了揭示新冠肺炎的免疫细胞群,对单细胞测序结果进行了无监督聚类,共获得了15个细胞群。根据经典细胞类型标记的表达进行鉴定方法,其中5个群体被注释为T细胞;4个群体被注释为B细胞。
图 来自参与者PBMCs的免疫细胞的单细胞基因表达谱
2、COVID-19和IAV患者PBMCs中浆细胞增多
在COVID-19和IAV感染的患者中,浆细胞和循环浆细胞的比例显著增加。随着浆细胞和相关转录因子表达的增加,相比于对照组,活化CD4+T细胞上CD2AP的表达也在增加。这些结果表明,随着患者血浆细胞升高,T细胞和NK细胞活性增强,可能有助于抵御病毒。
图 新型冠状病毒感染期间免疫细胞的动态组成和功能变化
3、COVID-19患者与IAV患者的免疫分子特征比较
对COVID-19与IAV患者的免疫分子特征比较结果显示,COVID-19和IAV患者的浆细胞浓度增加。进一步分析显示,COVID-19与IAV患者激活的信号通路的关键因子表达存在显著差异。这些因素包括新冠肺炎患者的白细胞介素和IL6ST表达相对增加,但与IAV患者相比,IL-6浓度同样增加,这支持了新冠肺炎患者促炎细胞因子增加的临床观察结果。
图COVID-19与IAV相比的特征
研究总结
综上所述,本文不仅对COVID-19和甲型流感病毒(IAV)感染患者外周血单个核细胞(PBMC)的单细胞转录情况进行深入解析,也揭示了新冠肺炎和IAV患者不同的免疫反应途径。
参考文献
Single-Cell Sequencing of Peripheral Mononuclear Cells Reveals Distinct Immune Response Landscapes of COVID-19 and Influenza Patients. Immunity. 2020
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