鹰潭高通量测序建设细节概述

鹰潭高通量测序建设有哪些值得关注的细节事项?SICOLAB小编从多角度带您畅聊实验室建设知识

一、高通量测序检测实验室简介

高通量测序检测实验室也叫NGS实验室,是以高通量测序技术为检测手段,来完成临床疾病筛查、诊断或辅助诊断、肿瘤基因突变检测等项目。高通量测序实验包括湿桌实验过程和干桌实验过程,其中湿桌实验是指实验标本预处理、核酸提取及其片段化、建库、扩增、靶序列富集、混样、测序前准备及测序,干桌实验是指测序后的数据分析、对比、注释和结果报告等生物信息学分析流程。由于NGS技术对所检测的核酸模板进行大量扩增,容易出现实验室污染导致检测结果不准确;且NGS实验要求高、影响因素多,实验过程处理不当也会导致检测结果异常。因此一个严格有序、规范的NGS实验室是非常必要的。

二、高通量测序建设注各区独立

1.实验室各个区域之间无论是否在使用,其在物理空间上应处于永久性的分隔状态;

2.实验室各区域之间不能有空气的直接流通,比如不可使用联通各区域的中央空调。

三、高通量测序实验室空气流向

临床基因扩增检验实验室的空气流向可按照试剂储存和准备区→标本制备区→扩增区→扩增产物分析区进行,防止扩增产物顺空气气流进入扩增前的区域。可按照从试剂储存和准备区→标本制备区→扩增区→扩增产物分析区方向空气压力递减的方式进行。

四、高通量测序实验室建设:强电、弱电需求

弱电:

建议每个房间预留1网络端口、1电话端口。并为高通量测序实验室配备独享8M以上的网络。

强电:

用电器分布大致如下:

试剂准备间:冰箱、冰柜等;总功率≤5kw

样本制备间:高速离心机、低速离心机、垂直混匀仪等;总功率≤10kw

扩增间:PCR仪、荧光定量PCR仪等;总功率≤5kw

测序间:UPS电源(测序仪、服务器都与UPS电源连接);UPS接入功率6KW

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