[Bug]samtools提示error while loading shared libraries: libcrypto.so.1.0.0

最新推荐文章于 2024-04-24 15:56:02 发布
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分类专栏： Bug 文章标签： python
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1、问题描述

  用conda安装的samtools，之前都可以正常使用，突然报错如下图：
samtools报错  此时正常的samtools --help都无法使用。
 

2、出现原因

  一般这个问题出现是用conda环境直接安装才出现的，现在samtools的版本已经在1.9以上了，但是conda安装的samtools版本依然是1.7，这是出现问题的根本原因。没错，本人的samtools版本就是1.7。
 

3、解决方法

  网上的思路大多让你重装1.9版本的samtools。但有一种方法非常取巧，通过人为创造一个libcrypto.so.1.0.0名称的二进制文件来解决。在conda安装samtools环境(work)下的lib目录软链接即可，在base环境软链是没有效果的。
libcrypto文件
  上述两种方法都放在了参考资料中。
  修复完成，结果如下图：
samtools软件

 

参考资料

1、Conda 下 samtools: error while loading shared libraries: libcrypto.so.1.0.0 解决办法
2、解决samtools: error while loading shared libraries: libcrypto.so.1.0.0/libncurses.so.5的问题

S_AGZX
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Conda 下 samtools: error while loading shared libraries: libcrypto.so.1.0.0 解决办法
菠萝西斯的博客
04-20 2626
samtools: error while loading shared libraries: libcrypto.so.1.0.0: cannot open shared object file: No such file or directory： 本质上就是samtools在执行的时候找不到lib里面的libcrypto.so.1.0.0 原因分析： 提示：首先看看自己小环境的lib： @hub $ ls /project/miniconda3/envs/hub/lib $ vi libcrypt
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libcrypto.so.1.0.0
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杜小帅的博客
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这个错误提示表明在运行./mongo命令时，系统无法找到名为libcrypto.so.1.1的共享库文件。共享库文件是一些可被多个程序共享使用的代码和数据的集合，它们在系统中被动态加载。解决这个问题的方法是确保系统中已经安装了所需的共享库文件。4.也可以通过安装libcrypto.so.*全部安装。
解决samtools: error while loading shared libraries: libcrypto.so.1.0.0: cannot open shared object file
hgz2020的博客
07-07 2473
通过细读报错，发现可能是libcrypto出现了问题问题成功解决！
【转载】【已解决】samtools报错error while loading shared libraries: libcrypto.so.1.0.0
luofunong的博客
09-19 592
samtools用conda 刚安好是可用的，但是装了其他一些软件后就有可能报错。
curl error while loading shared libraries libcrypto.so.1.0.0 解决方案
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11-26 6471
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samtools: error while loading shared libraries: libcrypto.so.1.0.0: cannot open shared object file
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这个问题是由于在使用samtools时无法加载共享库libcrypto.so.1.0.0而引起的。根据引用和引用的描述，这个问题出现时会显示"cannot open shared object file"。解决这个问题的方法是建立一个软链接，将libcrypto.so.1.1链接到libcrypto.so.1.0.0。这样，当samtools加载共享库时，它会找到正确的库文件并解决该问题。根据引用和引用的建议，你可以使用以下命令来解决这个问题： 1. 进入lib目录，可以使用cd命令进入目录。比如：cd /root/anaconda3/lib 2. 查看是否存在libcrypto.so.1.1文件。使用ls命令查看当前目录下的文件列表。 3. 建立软链接。使用ln命令建立软链接。具体命令是：ln -s libcrypto.so.1.1 libcrypto.so.1.0.0 通过执行以上步骤，你将能够解决"cannot open shared object file"的问题，并成功加载libcrypto.so.1.0.0共享库。<span class="em">1</span><span class="em">2</span><span class="em">3</span> #### 引用[.reference_title] - *1* *3* [解决samtools: error while loading shared libraries: libcrypto.so.1.0.0: cannot open shared object ...](https://blog.csdn.net/qq_54478153/article/details/121855758)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v93^chatsearchT3_2"}}] [.reference_item style="max-width: 50%"] - *2* [samtools: error while loading shared libraries: libcrypto.so.1.0.0: cannot open shared .........](https://blog.csdn.net/weixin_43960055/article/details/114992790)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v93^chatsearchT3_2"}}] [.reference_item style="max-width: 50%"] [ .reference_list ]

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