【转载】【已解决】samtools报错error while loading shared libraries: libcrypto.so.1.0.0

samtools用conda 刚安好是可用的,但是装了其他一些软件后就有可能报错

samtools: error while loading shared libraries: libcrypto.so.1.0.0: cannot open shared object file: No such file or directory

解决方案:

1. 找到libcrypto.so.1.1.1
一般在:~/anaconda/lib/libcrypto.so.1.1

===20210329补充===
如果你是在某个env下面装的samtools,那么就在某个env的lib下面找:
~/anaconda/env/你的env的名字/lib/libcrypto.so.1.1
=================

2. 建立软连接
 #进到这个文件夹
cd ~/anaconda/lib/ 
或者:cd ~/anaconda/env/你的env的名字/lib/

#建立软连接(类似win的快捷方式)
ln -s libcrypto.so.1.1 libcrypto.so.1.0.0

原理

这个问题在github issue中很多人提到,samtools开发者说这个anaconda的问题=-=
总的来说,就是这两个是一个东西,软链接骗过samtools,就能用了。



作者:AtlasBio
链接:https://www.jianshu.com/p/093522c89aef
来源:简书
著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处。

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这个问题是由于在使用samtools时无法加载共享库libcrypto.so.1.0.0而引起的。根据引用和引用的描述,这个问题出现时会显示"cannot open shared object file"。解决这个问题的方法是建立一个软链接,将libcrypto.so.1.1链接到libcrypto.so.1.0.0。这样,当samtools加载共享库时,它会找到正确的库文件并解决该问题。根据引用和引用的建议,你可以使用以下命令来解决这个问题: 1. 进入lib目录,可以使用cd命令进入目录。比如:cd /root/anaconda3/lib 2. 查看是否存在libcrypto.so.1.1文件。使用ls命令查看当前目录下的文件列表。 3. 建立软链接。使用ln命令建立软链接。具体命令是:ln -s libcrypto.so.1.1 libcrypto.so.1.0.0 通过执行以上步骤,你将能够解决"cannot open shared object file"的问题,并成功加载libcrypto.so.1.0.0共享库。<span class="em">1</span><span class="em">2</span><span class="em">3</span> #### 引用[.reference_title] - *1* *3* [解决samtools: error while loading shared libraries: libcrypto.so.1.0.0: cannot open shared object ...](https://blog.csdn.net/qq_54478153/article/details/121855758)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v93^chatsearchT3_2"}}] [.reference_item style="max-width: 50%"] - *2* [samtools: error while loading shared libraries: libcrypto.so.1.0.0: cannot open shared .........](https://blog.csdn.net/weixin_43960055/article/details/114992790)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v93^chatsearchT3_2"}}] [.reference_item style="max-width: 50%"] [ .reference_list ]

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