记numpy高速封装库bottleneck的一个bug

博主发现bottleneck库的move_mean函数在处理包含0的数组时,会产生非零的近似0值,这可能是由于C语言实现时的数据类型转换问题。尽管官方已知此Bug(Issue#332和#377),但尚未修复。因此,建议用户在使用时谨慎并检查结果。由于numpy的滑动窗口功能不够理想,bottleneck仍然是一个有挑战的选择。

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博主在使用bottleneck的移动平均函数时,对0的平均得到了很接近0的非零值,这是一个官方已知的bug,但是还未修复。

这些值的产生可能是因为bottleneck在底层用C编写函数的时候,数据类型转换出了问题。

因此,在使用bottleneck时,避免直接使用move_mean函数,而且切记要对结果进行检查,bottleneck这个库目前看来还不是很安全。奈何numpy本身对移动窗口函数的支持不好,numpy.lib.stride_tricks.sliding_window_view用起来不是那么方便,有时候效率也不高。

上述bug是官方已知的,属于open issue,参看bottleneck的github:

[BUG] move_mean gives negative values for array with no negative values in it · Issue #332 · pydata/bottleneck · GitHub

[BUG] get wrong result in move_mean · Issue #377 · pydata/bottleneck · GitHub

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