静息态功能磁共振成像(rs-fMRI)原理与数据分析学习笔记(1):Resting-State fMRI

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PPT:The R-fMRI Course | The R-fMRI Network

推荐就着另一个PPT看:fmri.april2011.pdf (harvard.edu)

目录

1. 脑部影像分析

1.1. 睁眼/闭眼脑区激活

1.2. 动手指/静息脑区活跃

1.3. 感觉运动/听觉/视觉/注意力网络脑部影像

1.4. 默认网络(DMN,default mode network)

1.5. 大脑任务态实验

2. 数据分析的基本计算方法

2.1. 整合(Integration approach)

2.2. 局部区域(Regional approach)

2.3. 图论(Graphical approach)

3. 方法学的问题

3.1. 头动(Head motion)

3.2. 标准化(Standardization)

3.3. 多重比较校正(Multiple-comparision correction)

4. 数据处理平台

4.1. DPARSF:流水线式fMRI数据处理软件(29%)

4.2. SPM(56%)

4.3. FSL(25%)


1. 脑部影像分析

1.1. 睁眼/闭眼脑区激活

(1)其中的紫色的小波纹被认为是噪声(noise)

(2)指定脑区在睁眼明显比闭眼时更加活跃

(3)蓝色线条为分别平均睁眼与闭眼时脑部状态,能更加明显地判断脑部活动差异

1.2. 动手指/静息脑区活跃

(1)c为辅助激活区

(2)尽管b处于静息态,多处脑区仍然显示活跃

1.3. 感觉运动/听觉/视觉/注意力网络脑部影像

1.4. 默认网络(DMN,default mode network)

(1)实验发现:无论做什么任务,总有些网络在负激活(即静息态高,任务模式低)

(2)默认网络:独立于任务的,负激活的网络

1.5. 大脑任务态实验

(1)任务态的主流是在任务范式上创新

(2)大多数的研究都是小样本研究

2. 数据分析的基本计算方法

2.1. 整合(Integration approach)

(1)方法:①功能连接(Functional Connectivity)

                    ②有效连接(Effective Connectivity)

                    ③层次聚类(Hierarchical Clustering)

                    ④自组织映射(Self Organization Map)

(2)对于大脑同步活动中时间序列的相似性

  

(3)提取一个单元(种子点)并分析它的时间序列,并用皮尔逊相关与其他区域进行比较

(4)独立组成分析(Independent Component Analysis)

 (5)体素脑镜像同伦功能连接(Voxel-mirrored homotopic connectivity,VMHC)

 监测对应体素,认为某些疾病会导致脑部区域功能的不平衡

(6)时间序列的预测和影响

若a时间序列的过去能预测b时间序列的将来,则认为a和b有因果/预测关系。但不同脑区对于刺激的反应时长不同,导致人们不一定能正确分析出驱动关系(甚至可能后被发现激活的脑区先发生,仅仅因为起效速度慢,而被认为是后发生的)。

2.2. 局部区域(Regional approach)

(1)局部一致性(Regional Homogeneity,ReHo)

看相邻体素的一致性

 (2)低频振幅(Amplitude of low frequency fluctuations,ALFF)

 不同脑区振幅/频率不同

 

ALFF是很好的噪声控制方式 

2.3. 图论(Graphical approach)

(1)脑部网络连接方法

①Cp:团块系数,衡量全局效率

②Lp:最短路径

(2)动态视角(Dynamic perspective)

3. 方法学的问题

3.1. 头动(Head motion)

(1)结构和功能都会出现这样的情况,给静息态造成很大的尾迹

3.2. 标准化(Standardization)

(1)Mean regression + SD division :控制中心效应

3.3. 多重比较校正(Multiple-comparision correction)

(1)太多样本导致单样本正确率高,但多样本正确率相乘反而会得到较低的正确率

(2)随机和计算下得到的连接最大的团块(?)

4. 数据处理平台

4.1. DPARSF:流水线式fMRI数据处理软件(29%)

4.2. SPM(56%)

4.3. FSL(25%)

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