静息态功能磁共振成像(rs-fMRI)原理与数据分析学习笔记(4-5):The R-fMRI Maps Project and Animal Data

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pdf:The R-fMRI Course | The R-fMRI Network

目录

1. The R-fMRI Maps Project

1.1. 解构,语义分析和诊断

1.2. 通过大脑对人体进行聚类(对于抑郁症)

1.3. Data Preparation 

1.4. Standardized Preprocessing

1.5. Quality Control

1.6. Data Upload

2. Animal Data

2.1. 数据处理

1. The R-fMRI Maps Project

1.1. 解构,语义分析和诊断

 

1.2. 通过大脑对人体进行聚类(对于抑郁症)

 

1.3. Data Preparation 

(1)dpabi→Utilities→DICOM Sorter将数据整合分类

1.4. Standardized Preprocessing

(1)见上次学习笔记:(10条消息) 静息态功能磁共振成像(rs-fMRI)原理与数据分析学习笔记(3):R-fMRI Data Processing DPARSFA_夏莉莉iy的博客-CSDN博客

1.5. Quality Control

(1)Reorient时会出现图像界面,可以对图像进行质量控制

 (2)常见的图像质量问题

        ①头动:有一圈一圈的尾迹,对于结构上的扫描非常影响

 

        ②Ghost影像

 

        ③化学位移伪影(Chemical shift artifacts):脂肪和水的共振频率不同,导致重合失调

       

 

        ④混叠伪影(Aliasing artifact):平衡泄露

        ⑤Spikes(Single peak in k-space):噪音过多

 

        ⑥Zipper:屏蔽没有做好

 (3)结构上无效影像案例(下图揣测为发胶和假牙)

 (4)功能上无效影像案例

 

1.6. Data Upload

(1)在The R-fMRI Maps Project录入数据

        ①底部Organize Intermediate Files可以存一些数据,这样下次在导入分析可以节省时间

        ②Organize Results就直接分析而不存了

(2)录入方式

        ①FTP

        ②网盘

        ③QQ邮箱超大附件

2. Animal Data

2.1. 数据处理

(1)在界面上可以看到DPABI for MONKEY Data

(2)人和动物大脑尺寸差异大,因此需要在Utilities→Voxel Size Augmentor里调整尺寸

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