到目前相信大家已经掌握了很多基础的图形制作方法,上次推送给大家介绍了玫瑰图。玫瑰图绚丽多彩,数据展现直观。韦恩图大家在数学中早已经见过,能够表示几个集合之间的关系。今天就由小编带领大家一起学习如何绘制韦恩图吧~
韦恩图
韦恩图(英语:Venn diagram),或译Venn图、文氏图、温氏图、韦恩图,是在所谓的集合论(或者类的理论)数学分支中,在不太严格的意义下用以表示集合(或类)的一种草图。
在转录组分析中,常常用韦恩图来表示各组之间差异表达基因数量的关系。
matplotlib_venn库
matplotlib_venn库:
python画图我们首先想到的是matplotlib库,强大的画图库。
然而,matplotlib库本身并不能绘制VENN图,需要借助第三方库matplotlib\_venn,当然matplotlib\_venn库也是依赖matplotlib库的。
下面,我们将分别利用matplotlib\_venn库的venn2和venn3函数来绘制两组数据和三组数据的Venn图。
venn2
代码:
import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib_venn import venn2
my_dpi=100
plt.figure(figsize=(800/my_dpi, 600/my_dpi), dpi=my_dpi)
venn2(
subsets = \[set(\[1,2,3\]),set(\[42,3,4,5\])\],
set\_labels=('A','B'),
set\_colors=('r','g')
)
plt.savefig(‘./test.jpg’)
plt.show()
运行结果:
函数详解:
**subsets:**必须的参数,即绘图所需的数据集,subsets接受三种格式的输入数据:
(1) 一个list,包含两个set元素,set中包含两个数据集集体的数据,即上述代码使用的方法;
(2)一个三个key字典,key是两个字符的二进制编码方式,所以三个key必须是“10”,“01”和“11”,value分别代表对应区域的大小,{'10': 2, '01': 3, '11': 1}
(3)一个包含三个数字的list,三个数字分别代表图形三部分的大小,\[2,3,1\]
**set\_labels**:设置数据的标签,即图形中两组数据的名称
**set\_colors:**设置图形的颜色
venn3
代码:
import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib_venn import venn3
my_dpi=100
plt.figure(figsize=(800/my_dpi, 600/my_dpi), dpi=my_dpi)
venn3(
subsets =\[set(\[1,2,3,5,9\]), set(\[1,2,4,6\]), set(\[1,3,4,7\])\],
set\_labels=('A','B','C'),
set\_colors=('r','g','b')
)
plt.savefig(‘./test.jpg’)
plt.show()
运行结果:
函数详解:
科研作图对分辨率有要求,可通过plt.figure()进行调整,图像的大小和dpi。
注意,图片的保存plt.savefig()一定要放在plt.show()之前,不然保存的就是一张空白图片。
**matplotlib\_venn库只能实现两组或者三组数据的韦恩图的绘制,更多数据集暂时不支持。**
以上就是“Python数据分析 | 数据可视化(十四)”的全部内容,希望对你有所帮助。
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