机器学习算法——概率类模型评估指标1(布里尔分数Brier Score)

概率预测的准确程度被称为“校准程度”,是衡量算法预测出的概率和真实结果的差异的一种方式。

一种常用的指标叫做布里尔分数,它被计算为是概率预测相对于测试样本的均方误差(MSE)。

MSE通常用作回归问题的损失函数。MSE的公式为

MSE = \frac{1}{n} \sum_{i=1}^{n} (Y_i-\hat{Y_i})^2

预测值为\hat{Y},真实值为Y。

由MSE推出布里尔分数(Brier Score)的公式为:

Brier \ Score = \frac{1}{N} \sum_{i=1}^{n} (p_i - o_i)^2

其中,N是样本数量,p_i为朴素贝叶斯预测出的概率,

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在R语言中,我们可以使用survival包中的survivalROC函数来计算综合布里尔得分。该函数可以计算各种生存模型的综合布里尔得分,而无需指定type参数。 以下是一个示例代码,展示如何使用survivalROC函数计算综合布里尔得分: ``` library(survival) # 创建生存数据 data(lung) lung$status <- ifelse(lung$status==1, 0, 1) # 拟合Cox比例风险模型 cox_model <- coxph(Surv(time, status) ~ age + sex + ph.ecog, data=lung) # 预测生存概率 lung$cox_prob <- predict(cox_model, type="lp") lung$cox_prob <- exp(lung$cox_prob)/(1+exp(lung$cox_prob)) # 计算综合布里尔得分 roc <- survivalROC(Surv(time, status) ~ cox_prob, data=lung, predict.time=seq(0, 60, by=1)) cindex <- roc$C brier_score <- roc$Brier ``` 首先,我们使用survival包中的data函数加载一个名为lung的生存数据集。然后,我们将status变量替换为逆变量(原始变量为1表示事件发生,0表示事件未发生,我们将其转换为1表示事件未发生,0表示事件发生),以便计算综合布里尔得分。接下来,我们使用coxph函数拟合一个Cox比例风险模型。然后,我们使用predict函数预测每个观察值的生存概率,并将其存储在cox_prob变量中。最后,我们使用survivalROC函数计算综合布里尔得分,其中predict.time参数用于指定预测生存概率的时间点。在这个例子中,我们使用0到60之间每一年的时间点进行预测。计算完成后,我们可以使用roc$C和roc$Brier分别获取C-index和综合布里尔得分的值。 需要注意的是,survivalROC函数假定生存数据集中的事件时间是单调递增的。如果事件时间不是单调递增的,则需要先对数据进行排序,以确保时间的单调性。

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