noncoding RNA as biomarker

Article Summary

NO.	标题	发表时间	刊物	IF	Summary
1	Circulating miR-181 is a prognostic biomarker for amyotrophic lateral sclerosis	2021.10.28	nature neuroscience	24.8	作者通过252位ALS患者, RNA-seq，研究了血浆中细胞外miRNAs 作为ALS 预测biomarkers的潜能
2	Long Noncoding RNA MIAT Controls Advanced Atherosclerotic Lesion Formation and Plaque Destabilization	2021.11.09	Circulation	23.6	对KE Biobank 中晚期颈动脉粥样硬化患者做RNA 转录表达差异分析（颈动脉斑块/非动脉粥样硬化对照动脉，发现 lncRNA MIAT 是上调最多的非编码RNA转录本，由qRT-PCR和原位杂交所证实。
3	A noncoding RNA modulater protentiates phenylalanine metabolism in mice	2021.08.06	Science	47.7	>作者阐明了老鼠lncRNA Pair 和人类HULC与苯丙氨酸羟化酶（PAH）有关联， Pair敲除鼠表现出过量血中苯丙氨酸（Phe), 色素减退、生长迟缓等，如实模拟了人类PKU。HULC消除会导致肝细胞PAH 酶活减低。机理：HULC -> interactions between PAH-substrate and PAH-cofactor -> PAH 酶活。作者开发了恢复肝脏lncRNA的治疗方式，设计了GalNAc-tagged lncRNA 模拟物，模拟物处理能降低Pair敲除鼠和Pah[R408W/R408W]鼠的过量Phe，改善这些老鼠的Phe耐受性。 >作者首先确定了E18.5和2月大的成年鼠肝脏的lncRNA谱，发现 2210408F21Rik（更名为Pair)上调最多的lncRNA之一。
4	A Novel Circulating MicroRNA for the Detection of Acute Myocarditis	2021.05.27	N Engl J Med	74.6	>作者发现一种新的环状microRNA, 用于急性心肌炎的诊断。 >研究方法：为了发现心肌炎特异性的microRNA, 做了microRNA微阵列基因芯片分析和心肌炎老鼠CD4+ T细胞和Th17细胞qPCR。然后设计引物，对患者和健康人的血浆进行qPCR扩增，发现患者扩增产物的量和克隆效率高于健康人，并且这个扩增产物的序列与老鼠mmu-miR-721是一样的，并且在哺乳动物中是高度保守。也就发现了 mmu-miR-721的人类对应物hsa-miR-Chr8:96，将来自急性心肌炎患者的血浆中这个microRNA hsa-miR-Chr8:96的表达与正常对照进行比较。
5	A novel microRNA-based prognostic model outperforms standard prognostic models in patients with acetaminophen-induced acute liver failure	2021.04.12	Journal of Hepatology	25.0	使用194位对乙酰氨基酚诱导的急性肝衰竭患者的血清样本，用qPCR板评估22个microRNA表达，开发了多元逻辑回归模型，用于急性肝衰竭预后。
6	MicroRNA-mediated regulation of glucose and lipid metabolism	2021.03.26	Nature Review Molecular Cell Biology	55.4	>人类microRNA目前记录566种，一般成熟的microRNA（21个核苷酸，大部分单链，也有双链）与Ago蛋白结合成miRISC后，通过碱基互补配对特异性靶向mRNA。这种物理结合使得mRNA翻译成蛋白的产量下降，加快mRNA的周转（turn over)。 >阐述了系统糖代谢中的miRNA，肥胖和2型糖尿病中的miRNA, 脂代谢中的miRNA, 与脂质有关的疾病中的miRNA及其作用， 还有血液循环miRNA(as biomarker)的代谢作用。