一、先下载GEO不同数据集的数据
2个文件:GPL平台文件+seri ……的矩阵文件
二、基因注释+normalize
基因注释过程中要看一下矩阵文件中有无负值,负值尽量不要此数据集
三、不同数据集之间的合并
四、去除合并后的批次效应(combat法)
一、先下载GEO不同数据集的数据
2个文件:GPL平台文件+seri ……的矩阵文件
二、基因注释+normalize
基因注释过程中要看一下矩阵文件中有无负值,负值尽量不要此数据集
三、不同数据集之间的合并
四、去除合并后的批次效应(combat法)