LAMMPS学习系列(7)

本文介绍了LAMMPS中compute命令的使用,用于计算原子的势能和力。通过示例展示了如何结合dump命令输出计算结果,并在ovito软件中进行可视化,以颜色编码显示原子的势能分布。
摘要由CSDN通过智能技术生成

定义原子/体系某些信息的计算(一)

这里只介绍一个命令:compute

这个命令可以帮助你计算你所想知道的原子/体系信息,例如:
在这里插入图片描述
compute 1 allpe/atom

表示计算每个原子的势能

compute 1 allporperty/atom fx fy fz

表示计算每个原子在x,y以及z方向上所受到的力

以之前介绍的简单弛豫的动态模拟为例:

在这里插入图片描述
在命令dump 1 all custom 100 W.xyz id type x y z 后面加上c_1(表示输出计算的原子势能):

dump 1 all custom 100 W.xyz id type x y z c_1

c为compute的缩写,1为这个compute的代号,

若写为compute x all pe/atom

则输出的写为c_x

将得到的W.xyz文件导入ovito软件中,然后在Add Modification中选择Color coding,然后在图示中的input property选项中选择c_1即可得被原子势能涂色的示意图:在这里插入图片描述
注:最好每换一帧记得点击一下Adjust range

评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值