MEGA软件做同源序列比对，粗略找到保守序列

最新推荐文章于 2024-08-30 08:51:56 发布

ZhangYiwen_Ya

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分类专栏：生物分子文章标签：笔记经验分享

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在NCBI下载基因序列：在NCBI下载多条序列，方便进一步实验，需要.fasta格式。
同源序列上传：打开MEGA软件----点击工具栏中的DATA----Open a file----选择对应的文件----打开----Align.
对其和裁剪：上面工具栏W----Align protein----OK----参数不用更改ok----等待分析完，对前后没有对其的序列选中----Delete删除。
直接导出：Data----Export Alignment----FASTA Foemate。
进行简单的保守序列查看：Display----Use Color点掉----Background Color点掉----Toggle Conserved Sites ----at 100% Level (显示等级)。白色的代表一样的为保守序列，黑色的为不一定保守序列。