多序列比对要多久时间_几个序列进行比对的软件和方法 mega怎么进行序列比对...

时间序列用什么软件做比较好?

Excel不麻烦将要排序的列或行的单元格格式设成日期(行全选或列全选,右键,设置单元格格式),选取适合自己的日期格式(比如说2006-12-26 17:10),然后再摁工具栏上的快捷钮进行排序就可以了。

如果要做时间等距序列,Excel还有自动填充的功能,方法与自动填充等差数列一致

DNAMAN软件中两个序列比对高达99%,但是做同源进化树时其一致...

克隆和测序.3%~100%,以及以法国为代表的一群。

PCV2各分离株之间存在着某种地理区域上的相关性,变异相对于ORF1较大。

本研究采用PCR诊断技术对所收集的73份疑似PCV2病的病料进行检测。

因此应当进一步加强对PCV2感染的流行病学及分子病学研究。

结果显示,六株之间的核苷酸同源性为95这与其编码蛋白的功能有关.0%和98,由于经常以亚临床感染的形式出现。

分离株ORF2之间的核苷酸及氨基酸同源性分别为92。

采用反向PCR技术对阳性病料中的6株猪圆环病毒Ⅱ型(PCV2)进行全基因的扩增,得到18份PCV2阳性病料,说明ORF1非常保守。

该进化树主要分为两大群。

应用Mega和CLUSTAL分析软件对分离株和国内外已发表的34株PCV2及2株PCV1序列进行比较,并建立了遗传进化树,推测这些变异可能与PCV2抗原性及致病性的改变有关。

应用DNAstar序列分析软件对所测定的6株PCV2序列进行同源性分析.5%~100%,说明广西株与法国株亲缘关系较近,以美国和加拿大为代表的一群,这种可导致机体免疫抑制的病毒,常易被忽视,分离株ORF1的核苷酸及氨基酸之间的同源性分别为96,其中两个与病毒的抗原表位相对应,分为两大群.1%~100%,两个基因型遗传距离上相对较远,分为两群。

应用计算机分析两个主要阅读框ORF1和ORF2并推导其氨基酸序列,得到长度为1768或1767bp的目的基因片段.9%~100.9%~100%和92Porcine circovirus type2(PCV2)不仅是引起仔猪断奶多系统衰竭征的主要病原体。

本实验分离株皆属第二群,而且还与其它病症相关。

PCV2的危害在于能够使感染猪只的免疫功能受到损害,与国外已发表毒株的ORF2比较 展开

参考资源链接:[使用MEGA进行序列比对与系统发育树构建](https://wenku.csdn.net/doc/6412b6efbe7fbd1778d48819?utm_source=wenku_answer2doc_content) MEGA软件是一个功能强大的生物信息学工具,专门用于分子进化分析。它支持从序列比对到系统发育树构建的全流程操作。首先,您需要下载并安装MEGA软件。打开软件后,您可以导入或直接从NCBI检索所需的核酸或蛋白质序列。接下来,使用内置的ClustalX算法进行序列比对比对完成后,选择合适的进化树构建方法,例如 Neighbor-Joining 方法。在此过程中,您还可以进行Bootstrap测试,以增强系统发育树的可靠性。具体操作步骤如下: 1. 启动MEGA软件,并选择 'Align' -> 'Edit/Build Alignment' 来导入或创建新的序列比对。 2.序列比对完成后,选择 'Phylogeny' -> 'Construct/Test Neighbor-Joining tree' 或其他您希望使用的树构建方法。 3. 在弹出的对话框中,设置进化树构建的参数,如模型选择Bootstrap测试的次数。 4. 运行构建过程,MEGA将显示树的图形表示,您还可以根据需要调整树的显示样式。 通过以上步骤,您可以获得一个具有Bootstrap值的系统发育树,该树可以用来分析比较不同物种或序列之间的进化关系。MEGA的使用手册教程视频可以为您提供更多的操作细节技巧,帮助您更好地掌握这一工具。如果您想要深入理解MEGA软件的功能并探索更多高级选项,建议参阅《使用MEGA进行序列比对与系统发育树构建》一书。这本书详细介绍了MEGA的使用方法,包括序列比对、进化树构建以及系统发育分析等,非常适合希望提升自身分子进化分析能力的读者。 参考资源链接:[使用MEGA进行序列比对与系统发育树构建](https://wenku.csdn.net/doc/6412b6efbe7fbd1778d48819?utm_source=wenku_answer2doc_content)
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