BGI-College生信入门——5、Linux下的软件安装与Vim编辑器

Linux basics

Linux系统下一切皆是文件，Linux文件系统包含排列在磁盘或其他区块存储设备目录中的文件

Linux文件系统是一个树状结构，以“/”目录为根目录 我们通过安装并且调用tree可以查看Linux文件系统的结构

#-d参数表示查看目录，-L参数表示查看的层级
tree -d -L 1

1. bin实际上就是binaries（二进制文件）的缩写，里面存放的命令可被普通用户和root用户调用
2. boot，译文是启动（计算机），里面存放着Linux启动时所需的核心文件
3. dev，是device（设备）一词的缩写，该目录存放的是Linux的外部设备。在Linux系统中，访问设备的方式和访问文件的方式是相同的
4. etc，即etcetera的缩写，该目录存放系统默认安装的配置文件
5. home，普通用户的主目录，Linux作为多用户操作系统，每个用户的目录都存在于home目录下
6. lib，指library（库），里面存放着系统最基本的动态链接共享库，其作用类似于Windows系统的DLL文件，简单来说，lib目录下的文件是应用程序、命令或进程正确执行所需的文件
7. lib64是lib的姊妹文件夹，lib64和lib几乎一样（除了架构级别的差异）
8. media，是Linux系统对U盘和光驱等识别后挂载的目录
9. mnt，系统提供该目录是为了让用户临时挂载别的文件系统，例如挂载移动硬盘进行文件传输
10. opt，是optional的缩写，这是给主机安装额外的软件存放的目录
11. proc，是Linux内核提供的一个文件系统（伪文件系统），用以在运行时访问内核内部数据结构、改变内核设置
12. root，该目录为系统管理员目录，也称作超级权限者的主目录
13. run，该目录是一个临时文件系统，存储系统启动以来的信息。当系统重启后，该目录下的内容即被清除
14. sbin，即superuser binaries（超级用户的二进制文件），存放着超级用户使用的系统管理程序
15. srv，用于存放本机提供的服务或数据
16. sys，是Linux2.6内核开始出现的文件系统sysfs，sysfs文件系统集成了3种文件系统的信息：针对进程信息的proc文件系统、针对设备的devfs文件系统和针对伪终端的devpts文件系统
17. tmp，是temporary的缩写，用来存放一些临时文件
18. usr，是unix shared resources的缩写，用户的很多应用程序和文件都存放在该目录下，类似于Windows系统的program files目录
19. var，是variable的缩写，用以存放不断扩充的文件，如日志文件

图中的/bin、/lib、/lib64和/sbin均有一个箭头符号，指向另外一个路径。实际这里是软连接的用法，相当于Windows下的快捷方式

绝对路径和相对路径

绝对路径，是指从根目录（/）开始的完整的文件路径，如/bin/bash
相对路径，是相对于当前目录位置而言的路径，如当前目录为/home/desktop，想要去到/home/software可以写成以下形式

cd ../software ##..表示上一级目录

常用的目录操作命令

cd，change directory，变换目录
pwd，print working directory，打印当前工作路径
mkdir，make directory，创建新目录
rmdir，remove diretory删除空目录 ls，list，列出目录和文件名
cp，copy，复制文件or目录
rm，remove，删除文件or目录
mv，move，移动文件or目录，