BGI-College生信入门——9、R语言基础（二）

ggplot2

Elegant Graphics for Data Analysis，用于数据分析的精美图形

ggplot2是一个用于数据统计和绘图的R包 与其它绘图包不同，ggplot2有自己的基础语法

ggplot2的逻辑就是基于图层的概念，把一张统计图中涵盖的元素按属性可以分成5大类：

1、几何对象
geometric object，简写成geoms，代表图中的点、线和多边形等
2、 尺度
aesthetic attributes，简写成aes，包括颜色、形状和大小等
3、数据的统计变换
statistical transformation，简写stats
总结数据，例如分类统计绘制直方图，或总结得出一个二维的线性模型
4、坐标系
coordinate system，简写coord
通过坐标轴和网格线展示
一般采用笛卡尔坐标系，同时支持其它坐标系（极坐标、地图投射等）
5、 分面
facet，指定绘图窗口划分为若干个子窗口

熟悉PS的朋友可能知道，在PS里绘图我们通过不断新建图层达到添加新元素的目的，ggplot2的图层概念与之类似

安装ggplot2

install.packages("ggplot2")

使用qplot绘制简单图形
ggplot2内置的数据集

绘图所用数据集为ggplot2内置的diamonds，该数据是53,940个钻石的价格和品质信息

钻石的4C标准：carat（克拉）、cut（切工）、color（色泽）和clarity（透明度）

head(diamonds)

carat	cut	color	clarity	depth	table	price	x	y	z
0.23	Ideal	E	SI2	61.5	55	326	3.95	3.98	2.43
–	–	–	–	–	–	–	–	–	–
0.21	Premium	E	SI1	59.8	61	326	3.89	3.84	2.31
–	–	–	–	–	–	–	–	–	–
0.23	Good	E	VS1	56.9	65	327	4.05	4.07	2.31
–	–	–	–	–	–	–	–	–	–
0.29	Premium	I	VS2	62.4	58	334	4.2	4.23	2.63
–	–	–	–	–	–	–	–	–	–
0.31	Good	J	SI2	63.3	58	335	4.34	4.35	2.75
–	–	–	–	–	–	–	–	–	–
0.24	Very Good	J	VVS2	62.8	57	336	3.94	3.96	2.48

图1 x、y、z、table和depth的测量方式

另外我们会从diamonds数据中随机产生一个包含100个钻石品质信息的数据子集dsmall

set.seed(2022) #设置随机数种子，根据种子编号产生可重复的伪随机数