介绍
零代码复现4与之前的套路8中性泛癌的文章基本是一致的,文件解读可看链接:
我们将该复现的代码进行了工具化,先介绍一下适用场景
可以针对特定的基因集进行泛癌相关的分析,这个特定的基因集,可以是前人分析得到的,也可以是从单细胞分析获取的某一个亚群marker基因。
话不多说,直接看如何分析。
输入网址,直接进入零4复现的页面
1、提取特征基因集表达矩阵
首先我们需要准备一个基因集的列表,如这里默认准备的是中性粒细胞的相关基因集,这里的基因来自于已经发表的文章,详细的可以看套路8的介绍。
记得,这里的生存时间默认0,是提取总生存时间(OS)大于0天的肿瘤组织样本。当然有的文章中,也会写上30,也就是生存时间大于30天的样本会纳入分析。
提交后,设置任务名,该步很重要,会计入运行次数,运行成功后,即可进行第二步
2、单因素cox分析筛选预后相关的基因
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