亚群注释原来这么简单

首先,高级分析的任务数据,必须是从高级分析准备中创建的

如导入基础分析的数据

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链接:单细胞工具 - 生信豆芽菜 - 专门做分析的生信平台

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亚群注释来自于自动化注释的方法

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选择任务队列的数据

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如这里选择garnett的方法,需要上传一个细胞的特征基因集,特征基因集包含两列的信息,第一列为细胞名,第二列为基因名。记得细胞名不要出现冒号,封号,逗号这种字符,尽量都写成字母和数字,不要以数字开头

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同样的选择ssGSEA的方法,该方法是基于富集分析的方法进行的注释

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当然也可以选择用singleR的方法进行注释

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记得这里很重要!!!!!!

在注释完成后,我们需要回到基础分析中新增注释信息,把注释信息添加进入,重新进行分析。

单细胞分析工具的重新修改上线,旨在更加系统简便的为大家提供更加优质的单细胞分析工具。

希望我们上线的新单细胞工具,不如为我们点个赞吧,我们会不断的努力,不断的优化。

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