TBSS简介和预处理

TBSS(tract-based spatial statistics)是一种分析扩散加权成像(DWI)数据的方法,通过构造纤维束骨架并投射FA图像进行统计分析。预处理包括脑提取、涡流/头动校正、张量拟合等步骤。使用FSL和TrackVis工具进行处理,如涡流校正用`eddy_openmp`,张量拟合用`dtifit`,纤维束追踪则在TrackVis中完成。

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TBSS-----------------------------------------------------------------------

    TBSS概述

        使用 TBSS 分析 DWI 数据-Alex / 2019-08-30 / free_learner@163.com

            由于图像非线性配准不够准确,所以首先根据所有被试的FA(fractional anisotropy)图像构造出一个纤维束的骨架(skeleton),用该骨架来表征纤维束。

            构造骨架的原则大致是,如果纤维束是一层(sheet),就用一个平面来表示,如果是管状(tube),则用一条线来表示;构造好骨架后,就把所有被试的FA图像投射到骨架上,实际上就是搜索骨架方向上的最大值;最后对投射到骨架上的FA 值进行统计分析。所以(我认为)TBSS就是对数据做了一种简化,将相邻体素的值选择一个最大值来进行统计分析。

        使用FSL和TrackVis分析DTI数据 – 学习记录 (learning-archive.org)

            bval-b值 和 bvecs-方向 这两个文件表示什么意思?

                DWI 的大致原理是在不同方向上施加一个梯度磁场,

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