小杜 才疏学浅的医学数据分析资料

最新推荐文章于 2024-10-12 08:45:21 发布
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分类专栏： 医学数据挖掘 文章标签： 数据挖掘
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本文链接：https://blog.csdn.net/blinkhor/article/details/115076121
版权
这篇博客汇总了丰富的医学数据分析资源，包括肿瘤数据库、遗传变异数据库、DNA甲基化数据库等，并涵盖了模型、综述前沿、竞赛顶会和相关课程。资料来源多样，包括国家微生物科学数据中心、肿瘤生物信息数据库等，同时提及了多个数据集、模型和医学相关网站，如Kaggle、PubMed等。
摘要由CSDN通过智能技术生成

小杜 才疏学浅的医学数据分析资料

一个小杜logo

初衷

我想分享一下我的小资料（资料放吃灰不存在的）

人最大的敌人，往往不是来自外界，而是来自内心。

具体而言就是两者：一是对未来不确定的担忧和恐惧，二是对无法改变的后悔和遗憾

当你的生命足够丰满、充实的时候，你再回过头来看自己，就会发现：

哪有什么阴霾，不过都是尘埃。

月亮能够普及全球，只要我们抬起头来。

tags: 医学信息 生物信息 公共卫生 数据分析

资料来源：知乎；微信公众号；GitHub；

文章目录

📝 资料列表

💻数据

  1. 国家微生物科学数据中心

    包括重点数据库，科技项目汇交专题，分析平台等等，超级权威

  2. 肿瘤生物信息数据库

综合性肿瘤数据库
  1. TCGA：（The cancer genome atlas）
  2. ICGC：（International Cancer Genome Consortium）
  3. COSMIC
  4. cBioPortal
  5. UCSC Cancer Genomics Browser
  6. canEvolve
  7. CGWB(Cancer Genome Workbench )
肿瘤转录组数据库
  1. Oncomine
  2. GEO（Gene Expression Omnibus）
  3. ArrayExpress
  4. ChiTaRS
  5. miRCancer
  6. OncomiRDB
  7. UALCAN
  8. CRN(Cancer RNA-Seq Nexus)
肿瘤基因组数据库
  1. ArrayMap
  2. BioMuta
  3. Cancer Hotspots
  4. Mitelman Database
  5. SomamiR
  6. CGP (The Cancer Genome Project)
遗传变异数据库
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专栏目录
第1节:医学数据分析实例以及完整流程 (含数据集)
03-04 1173
数据集 链接: https://pan.baidu.com/s/14_-XYy2PMl_ugpQxSt5m7g 提取码: 1hqm 数据分析结果 [外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-hMpMvx0Q-1646386246175)(https://raw.githubusercontent.com/errolyan/tuchuang/master/uPic/tOk9u1.tif)] [外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-k
TCGA数据库中WSI图像的切割
weixin_52486108的博客
04-17 5076
病理学WSI组织学图像的分割
Python库 | histolab-0.0.4b0-py3-none-any.whl
03-31
资源分类：Python库 所属语言：Python 资源全名：histolab-0.0.4b0-py3-none-any.whl 资源来源：官方 安装方法：https://lanzao.blog.csdn.net/article/details/101784059
MetaDB:MetaDB 是一个用于代谢组学元数据管理和数据处理的开源 Web 应用程序。 它基于 ISA-Tab 作为元数据输入格式。 非目标数据的分析是使用 R 包 MetaMS 完成的。 该软件是 Fondazione Edmund Mach 的一个项目
06-07
元数据库 MetaDB 是一个用于代谢组学元数据管理和数据处理的开源 Web 应用程序。 它基于作为元数据输入格式。 非目标数据的分析是使用 R 包。 该软件是 Fondazione Edmund Mach 的一个项目。 概述 工作流程 介绍 ISAtab 创建 MS数据采集和转换 数据处理和可视化 数据提交到公共存储库 用户文档 使用权 登录 搜索 上传 加载和查看 设置 安装 先决条件 获取代码 运行单元测试 准备您的配置 安装 R 包 执照 1. 工作流程 介绍 代谢组学的 ISAtab 文件最好使用 MetaboLights 的创建。 ISAtab 文件可以作为 ZIP 文件上传到MetaDB 。 然后将选定的检测导入MetaMS 。 MetaDB 负责给定样本的随机化。 随机样品列表可以 CSV 格式导出，然后用于设置您的 MS 采集。 获得的运行被导入回MetaMS ，在那
论文笔记：m6Acorr: an online tool for the correction and comparison of m6A methylation profiles
wangpan007的博客
10-14 718
文章目录前言必备生物知识一、论文创新点二、背景 前言 论文发表期刊：《BMC BIOINFORMATICS》 期刊影响因子：3.242 期刊中科院分区：生物 3 区 m6Acorr服务器： http://www.rnanut.net/m6Acorr 校正函数及数据网址： https://github.com/emersON106/m6Acorr 补充材料网址： https://doi.org/10.1186/s12859-020-3380-6 作者简介：李建伟来自河北科技大学，黄燕来自北京大学 必备生物知识
小杜记事本
02-21
小杜专用记事本 易语言制作 大家可以研究一下
love:小杜一直爱小赵啊:heart_suit:
08-04
love story 这是一个关于小赵和小杜的故事
Mysql使用insert插入多条记录 批量新增数据
12-16
在MySQL数据库中，批量插入数据是一项常见的操作，特别是在处理大量数据时，批量插入可以显著提高效率。本篇文章将深入探讨如何正确使用`INSERT`语句来插入多条记录，并讨论相关的优化策略。 首先，让我们来看一下...
用python写一个做出histogram图的程序
weixin_42593130的博客
02-14 112
下面是一个使用 Python 绘制直方图的简单代码示例： import matplotlib.pyplot as plt data = [2, 5, 1, 6, 8, 2, 4, 5, 6, 7, 8, 6, 4, 7, 8, 9, 6, 4] plt.hist(data, bins=9, edgecolor='black') plt.xlabel('Data') plt.ylabel('Fre...
tiatoolbox:TIA Lab开发的计算病理学工具箱
04-13
TIA工具箱 在TIA中心开发的计算病理学工具箱 所有用户 该软件包适用于对数字病理学感兴趣的人员：包括研究生，医务人员，TIA中心和PathLAKE的成员以及任何可能发现其有用之处的人。 考虑到病理学，显微镜，计算机和相关学科的发展，我们将继续改进此软件包。 请发送评论和批评至 。 tiatoolbox是一个多用途名称，我们将其用于1）某个计算机程序，2）相关程序的Python包，由我们在TIA中心创建，以帮助人们开始使用数字病理学，3）该存储库，4）虚拟环境。 开发者 任何想对此存储库做出贡献的人，请先查看我们的和的网页。 另请参见本文档的“准备开发”部分。 链接（如果需要） shell在所有常见平台上均可用。 本自述文件中的命令位于bash中。 Windows用户可以使用命令提示符安装conda和python软件包。 是用于软件包和的管理系统。 要获取conda ，请使用2
医学公共数据库
weixin_46587777的博客
05-26 8891
医学公共数据库 01 NCDB 网址：https://www.facs.org/quality-programs/cancer/ncdb 美国国家癌症数据库(National Cancer Database, NCDB)是经国家认证的，由美国外科医师学会和美国癌症学会联合组建的，它是一个基于医院登记数据的临床肿瘤学数据库，来源于超过1500多个癌症委员会认证的机构。NCDB数据库可用于分析和跟踪恶性肿瘤患者的治疗过程和结局。数据库代表了全美超过70%的新诊断癌症病例和超过三千四百万个历史记录。 02 SEE
上海交大：我们做了一个医疗版MNIST数据集，发现常见AutoML算法没那么好用
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11-03 107
来源：机器之心作者：魔王、张倩上海交大研究人员创建新型开放医疗图像数据集 MedMNIST，并设计「MedMNIST 分类十项全能」，旨在促进 AutoML 算法在医疗图像分析领域的研究...
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联邦学习实战——联邦学习医疗健康应用案例前言1. 医疗健康数据概述2. 联邦医疗大数据与脑卒中预测2.1 联邦数据预处理 前言 FATE是微众银行开发的联邦学习平台，是全球首个工业级的联邦学习开源框架，在github上拥有近4000stars，可谓是相当有名气的，该平台为联邦学习提供了完整的生态和社区支持，为联邦学习初学者提供了很好的环境，否则利用python从零开发，那将会是一件非常痛苦的事情。本篇博客内容涉及《联邦学习实战》第十二章内容，使用的fate版本为1.6.0，fate的安装已经在这篇博客中介绍
深度学习：综述：医疗影像数据+CV数据集
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11-10 1万+
GitHub：https://github.com/albarqouni/Deep-Learning-for-Medical-Applications 医疗数据集：https://blog.csdn.net/Suii_v5/article/details/77920948?locationNum=10&fps=1 乳腺MG数据获取:https://blog.csdn.net/dcxhu...
mysql数据库常用语句，从小白到精通：总句篇
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数据库的知识点主要分为： DDL：数据库定义语言： #1.对数据库级别的操作 #DDL对数据库级别的操作常用6条语句 show databases; #展示数据库，查看有多少数据库 show create database 数据库名;#展现创建数据库的语句（因为自己写的不是真正的创建语言，数据库会对使用者的语言进行在编译） update database 数据库名 set character 编码...
《机器学习与数据挖掘综合实践》实训课程教学解决方案
whwzzc的博客
10-12 1534
机器学习与数据挖掘综合实践》实训课程的教学解决方案，通过科学的目标设定、系统的内容组织、创新的教学方法、实用的实训平台构建以及有效的评估反馈机制，旨在构建一个以学生为中心，注重理论与实践结合，鼓励创新与合作的学习环境。其核心目标在于通过自动化的方式，让机器能够识别、理解和预测数据中的模式和规律。总之，方案建立了全面而科学的评估与反馈机制，旨在通过多元化的评价手段、即时的反馈和定期的教师研讨会来全面评估学生的学习成效，帮助学生更好地掌握知识和技能，同时也不断优化教学内容和教学方法，以提供更优质的教学服务。
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