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RSS订阅原创 Plant Biotechnology Journal：应用DAP-seq技术助力揭示GhRCD1调节GhbHLH12–GhMYB44–GhHMA1转录级联反应促进棉花对镉的耐受机制
使用DNA亲和纯化测序（DAP-seq）等分子相互作用研究方法，发现了调节棉花Cd2+耐受性的分子级联反应，揭示了GhRCD1通过调控GhbHLH12-GhMYB44-GhHMA1转录级联通路响应镉胁迫的分子机制，为培育耐镉棉花新品种和通过植物修复手段降低镉污染提供了新思路
2024-04-29 14:07:18
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原创 DAP-seq助力揭示转录因子在草地贪夜蛾Bt抗性中重要作用
利用DAP-seq等技术阐明了转录因子SfGATAe对毒素受体基因SfABCC2表达的调控机制，并全面阐释了这种转录调控机制对草地贪夜蛾Bt抗性产生的重要影响。
2024-04-25 13:54:16
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原创 DAP-seq与RNA-seq联合分析助力揭示AvERF73通过参与低氧应答和甲羟戊酸途径正调控猕猴桃的耐涝性
AvERF73是猕猴桃耐涝性的重要调节因子。一方面，过表达AvERF73可以激活AcNAC022的表达，以应对涝胁迫引起的缺氧。另一方面，过表达AvERF73可能通过直接激活AcHMGS1表达来调节合成萜类化合物和甾醇的MVA途径。
2024-04-24 11:33:24
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原创 应用Ribo-seq技术量化tRNA对乳腺癌细胞转移的调控
Ribo-seq技术检测到核糖体结合的转录本与tRNA表达显著相关，将基因表达调控中的转录过程与翻译过程关联起来，可以通过检测mRNA核糖体保护片段（RPF），识别翻译过程中的tRNA调控事件。Ribo-seq技术可以与DAP-seq/ChIP-seq、RNA-seq、tRNA-seq和质谱等技术一起，将基因表达的调控过程完整呈现出来。
2024-04-09 16:32:39
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原创 Ribo-seq：检测正在翻译的mRNA信息，连接转录组学与蛋白质组学的桥梁
核糖体印迹测序(Ribosome profiling, Ribo-seq)检测正在翻译的RNA信息，揭示蛋白合成的时间,位置,以及蛋白质合成的调控机制
2024-03-05 10:03:13
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原创 Plant Physiology：应用DAP-seq技术鉴定BcERF070下游靶基因，揭示乙烯调控小白菜开花的分子机制
使用DNA亲和纯化测序（DAP-seq）技术鉴定了小白菜中BcERF070的下游靶基因，揭示了BcERF070响应乙烯抑制小白菜开花的潜在分子机制。
2024-02-29 13:17:53
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原创 Plant, Cell & Environment：DNA pull down技术助力揭示AP2/ERF类转录因子提高芍药耐高温能力的分子机制
DNA Pull Down—高效鉴定与特定DNA序列结合的蛋白（转录因子或者DNA结合蛋白），帮助寻找目标基因的上游调控因子。
2024-02-01 16:48:58
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原创 Plant Stress：应用HaloTag pull-down技术鉴定了与胡杨CPK21互作的重金属胁迫相关蛋白
Halo/FLAG-tag pull down（蛋白Pull down）技术，蓝景科信使用真核表达系统进行实验，经验丰富，成功率高，周期短。检测已知蛋白质之间的相互作用，鉴定与已知蛋白相互作用的未知蛋白。
2024-01-29 10:20:35
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原创 Plant Physiology：转录因子PpNAC1和DNA去甲基酶PpDML1协同调控桃果实成熟
该研究使用了DNA亲和纯化测序（DAP-seq）技术鉴定了PpNAC1转录因子的结合基序和靶基因。研究发现转录因子PpNAC1和DNA去甲基酶PpDML1协同调节桃果实中乙烯合成、果肉软化和风味形成的分子机制。
2024-01-22 15:14:12
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原创 The Plant cell：DAP-seq技术助力揭示BBR/BPC家族的MdBPC2转录因子调控苹果生长素的生物合成从而促进苹果生长及矮化
MdBPC2调控MdYUC2a和MdYUC6b的转录，抑制生长素的生物合成，从而调节植物结构。
2024-01-15 16:39:52
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原创 Oil Crop Science：DAP-seq技术揭示花生中AhTWRKY24和AhTWRKY106转录因子下游调控基因
AhTWRKY24和AhTWRKY106转录因子不仅序列相似性高，而且都通过结合W-box元件来调节下游基因。它们既可以协同调控下游基因，也可以特异性调控下游基因来参与对干旱胁迫的响应，但两者所调控下游基因的数量无明显差异。该结果为进一步研究AhTWRKY24和AhTWRKY106转录因子的功能和调控网络提供了参考。
2023-11-03 11:45:25
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原创 Plant Physiology：DAP-seq助力揭示YABBY11转录因子调控杨树叶形自然变异的分子机制
该研究使用DNA亲和纯化测序(DAP-seq)技术鉴定了杨属YABBY11转录因子的结合基序和靶基因。发现YABBY11与杨树叶形自然变异显著关联，为探索理想叶形遗传改良奠定了理论基础。
2023-10-30 11:49:20
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原创 植物转录因子研究策略及方法
蓝景科信专注为国内高等院校和研究机构提供创新的技术解决方案和应用工具。尤其是对于分子间相互作用的研究。我们拥有100+物种，1000+转录因子的DAP-seq实验经验。
2023-10-11 15:22:00
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原创 New Phytologist：DAP-seq技术在GhRCD1通过GhMYC3-GhMYB44-GhLBD18转录级联调控陆地棉体细胞胚胎发生机制研究中的应用
郑州大学与中棉所棉花生物学国家重点实验室的研究成果发表在New Phytologist（IF=9.4，Q1区）期刊上，题目为“GhRCD1 regulates cotton somatic embryogenesis by modulating the GhMYC3-GhMYB44-GhLBD18 transcriptional cascade”。该研究使用DNA亲和纯化测序(DAP-seq)技术鉴定了陆地棉GhMYC3的结合基序和靶基因。
2023-08-08 11:38:29
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原创 Horticultural Plant Journal ：DAP-seq技术在MdWRKY115通过调控MdRD22的表达增强苹果抗旱性和渗透胁迫耐受性研究中的应用
该研究发现了苹果中与干旱和渗透胁迫耐受性相关的一个调控因子MdWRKY115，并采用DAP-seq技术鉴定了MdWRKY115的结合元件及靶基因MdRD22。揭示了MdWRKY115通过与MdRD22启动子结合，调控MdRD22的表达，提高苹果对干旱和渗透胁迫的耐受性。
2023-07-14 14:33:54
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原创 Plant Physiology：DAP-seq技术在毛白杨PtoWRKY68等位基因变异调控干旱胁迫响应机制研究中的应用
与充足水分条件下相比，在干旱条件下植物的水分利用效率（WUE）、ABA水平、脯氨酸水平（PRO）均显著提高，气孔导度（Gs）、细胞间CO2浓度（Ci）、蒸腾速率（Tr）、叶绿素含量（Chl）则显著下降。因此，研究干旱胁迫下树木生理和光合作用变化的分子机制，将有助于培育耐旱性树木新品种，增强林木的生产力和经济价值。数据中的结合峰值、荧光素酶报告实验(DLRA)、凝胶阻滞实验（EMSA），说明了与PtoWRKY68hap2相比，PtoWRKY68hap1对靶基因的启动子具有更高的亲和力。
2023-07-06 15:00:00
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原创 转录调控研究技术之：DNA亲和纯化测序（DAP-seq）
传统的染色质免疫共沉淀测序（ChIP-seq）方法，在抗体质量很好的情况下能够有效检测到TFBS。2016年，O'Malley RC等人在Cell上发表了使用DAP-seq技术，快速绘制转录因子调控靶向DNA区域的顺反组和表观组图谱的文章。DAP-seq技术不仅可以用于模式物种的研究，同样适用于非模式物种，尤其是植物。因此，DAP-seq技术的出现，使TFBS的研究不再局限于任何生物，不再受抗体质量的限制，为生命科学领域转录因子的研究提供了新型高效的工具。DAP-seq技术流程图。
2023-06-30 16:50:12
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原创 Plant, Cell & Environment：DAP-seq技术在ZmEREB57调控OPDA合成提高玉米耐盐性研究中的应用
该研究使用DNA亲和纯化测序(DAP-seq)技术鉴定了玉米中一个AP2/ERF转录因子的结合基序以及靶基因。揭示了ZmEREB57通过两个不同的信号途径调控玉米OPDA合成增强耐盐性的分子机制，为耐盐性植物新品种的培育提供了重要的遗传资源。
2023-06-30 14:54:32
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原创 Frontiers in Microbiology：DAP-seq技术在猪苓C2H2转录因子PuCRZ1调控菌丝生长及渗透胁迫耐受性机制研究中的应用
DAP-seq高通量地检测转录因子在基因组上的结合位点，鉴定下游靶基因。蓝景科信拥有100+物种，1000+转录因子的DAP-seq实验经验。
2023-06-16 18:09:14
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原创 DAP-seq技术鉴定葡萄MADS-box转录因子VvMADS28的靶基因，揭示葡萄胚珠发育的调控机制
DAP-seq高通量地鉴定转录因子在基因组上的结合位点，预测下游基因。该研究使用DNA亲和纯化测序（DAP-seq）技术鉴定了葡萄中一个MADS-box转录因子的结合基序及其靶基因，揭示了VvMADS28参与葡萄胚珠和种子发育的调控机制，为培育无籽葡萄新品种奠定了理论基础。
2023-05-15 17:03:07
830
原创 siPOOLs（一款高效、特异性好的RNAi试剂，可有效消除脱靶效应）
siRNA pools（siPOOLs）是一款经过优化设计的、高复杂性的、包含30条siRNA的混合物，经证明可有效消除脱靶效应，提高了结果的可靠性。 Pack Hunter (pooling) 方法通过将当个siRNA的浓度稀释到刺激表型的阈值以下来对抗单个siRNA的脱靶。 借助专有的设计算法，siPOOLs中的siRNA序列经过优化，以实现最大的转录本覆盖率，高效杂交并对旁系同源基因进行过滤，从而实现高效和特异性的基因沉默。
2023-04-12 16:35:31
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原创 应用DAP-seq技术鉴定百脉根中一个NAC转录因子在全基因上的靶基因，揭示硝酸盐诱导根瘤衰老的新机制
本研究采用高浓度硝酸盐处理百脉根，对根瘤样品进行转录组测序分析，与已有的两个根瘤早衰突变体转录组数据进行联合分析，鉴定到一个转录因子Lj2g3v1058050，该基因受硝酸盐诱导上调表达，并且在早衰根瘤突变体中显著上调表达。综上所述，在硝酸盐诱导的根瘤衰老过程中，NAC094正调控根瘤衰老，位于NLP1/NLP4的下游，通过激活衰老相关基因参与调控硝酸盐诱导的根瘤衰老过程。的缺失能够缓解硝酸盐诱导的豆血红蛋白的降解，同时阻断了根瘤中由硝酸盐诱导的衰老相关基因的上调表达。的缺失，抑制了硝酸盐诱导的。
2023-04-11 17:08:08
673
原创 DAP-seq技术鉴定全基因组水平上的ZjVND7靶基因，揭示酸枣全基因组复制在调节木质部导管分化和耐旱性中的作用
全基因组复制对生物体的影响是多方面的。采用DAP-seq技术对干旱胁迫下二倍体和同源四倍体酸枣中ZjVND7的靶基因进行了全基因组研究，鉴定了二倍体和同源四倍体酸枣之间结合基序的差异。与二倍体相比，同源四倍体中更多的ZjVND7靶基因可能参与干旱条件下细胞生长和胁迫信号相关的途径，包括：木质部发育、次生壁合成、细胞死亡、细胞分裂和 DNA内复制。本研究发现同源四倍体酸枣中木质部导管和薄壁细胞的数量增加，是二倍体酸枣的近两倍，这可能与木质部导管分化相关调节的NAC家族转录因子ZjVND7的表达差异密切相关。
2023-04-11 17:05:55
737
原创 DAP-seq文章合集-蓝景科信
100+物种，1000+转录因子的实战经验，高通量鉴定转录因子的下游基因，已助力多篇文章发表知名期刊，例如：Molecular Plant，The Plant Cell，Plant Physiology，Plant Biotechnology Journal，Journal of Integrative Plant Biology等。
2023-03-16 15:21:56
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原创 中棉所李付广团队揭示油菜素内酯（BR）调控棉花纤维伸长新机制；DAP-seq助力发表Plant Cell文章
期刊：Plant CellIF=12.085
2023-03-13 09:29:11
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原创 scRNA-seq及DAP-seq技术联合应用揭示了比克氏棉色素腺体的发育轨迹和转录调控网络；2023年DAP-seq技术助力发表Molecular Plant文章
期刊：Molecular Plant影响因子：21.949
2023-02-24 15:14:28
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原创 DAP-seq技术在ERF114调控苹果根系抵御腐皮镰刀菌侵染的分子机制研究中的应用；DAP-seq2023发表Plant Physiology文章
期刊 Plant Physiology影响因子 8.005
2023-02-16 11:56:31
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原创 myBaits Target Capture Kits；myBaits 靶向捕获试剂盒，快速捕获富集目标序列
myBaits Target CaptureKits可以快速捕获富集目标序列，提高NGS研究效率，兼容Illumina®，PacBio® 和 Nanopore®等多种测序平台。
2023-02-02 14:25:44
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原创 DAP-seq技术在bHLH-zip转录因子SREBP调控灵芝中三萜类化合物和脂质代谢研究中的应用；2023年发表Communications Biology文章
期刊：Communications Biology影响因子：6.548
2023-01-28 14:51:27
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原创 myBaits Expert Wheat Exome — 从多个小麦品种中富集超过250Mb的高可信度的外显子
myBaits Expert Wheat Exome 探针与国际小麦基因组测序联盟合作开发，使用了IWGSC发布的中国春基因组和注释信息。靶向六倍体小麦中完整的高置信度且有基因注释的外显子区域,能够全面、统一、可靠地深入覆盖大干15Gb的小麦基因组中超过250 Mb的CDS及其邻近区域。该panel包含两百多万条探针，运用优化算法设计，并经过实验进一步优化，兼容市面上已知的文库制备方法及测序平台。
2023-01-13 13:47:37
432
原创 DAP-seq技术在GhBES1.4介导的BR对陆地棉纤维伸长调控网络研究中的应用 | DAP-seq 2022年发表Plant Physiology文章
期刊：Plant Physiology影响因子：8.005
2023-01-04 16:21:15
202
原创 myBaits Expert Whole Genome Enrichment (WGE) 从复杂的DNA来源捕获全基因组DNA
myBaits Custom WGE 是捕获全部核基因组序列的生物素化 RNA 探针，适用于从复杂的宏基因组样本(如环境或古代 DNA)中批量富集全基因组内源性 DNA。
2022-12-30 15:50:45
574
原创 myBaits Expert Human Affinities Kit ——捕获人类样本中的 SNPs 信息，化石、法医样本和降解 DNA 样本均适用
捕获人类样本中的 SNPs 信息，化石、法医样本和降解 DNA 样本均适用。由遗传进化专家设计测试，位点富含有效信息，分辨率高。
2022-12-30 15:23:58
602
原创 DAP-seq技术在NAC转录因子负调控水稻对稻瘟病免疫反应分子机制研究中的应用|DAP-seq 2022年发表Journal of Integrative Plant Biology文章
期刊：Journal of Integrative Plant Biology影响因子：9.106
2022-11-15 11:17:56
500
原创 DAP-seq技术在ScAIL1靶向调控DELLA参与GA和JA信号通路的应用
期刊：Journal of Experimental Botany影响因子：7.298
2022-11-08 16:47:29
293
原创 The Plant Journal：DAP-seq应用于褪黑素促进种子萌发的分子机制研究
期刊：The Plant Journal影响因子：5.726
2022-11-07 16:17:02
255
原创 DAP-seq技术在研究谷氧还蛋白MeGRXC3调控木薯响应干旱胁迫分子机制中的应用
期刊：Plant Biotechnology Journal影响因子：13.263
2022-10-28 16:05:55
245
原创 DAP-seq文章 | DAP-seq技术在R2R3-MYB转录因子LmMYB15调控金银花绿原酸生物合成和苯丙素代谢的分子机制研究中的应用
期刊：Plant Science影响因子：5.363
2022-10-21 11:44:05
555
原创 myTags 定制原位杂交探针，可用于染色体绘制，染色体索引，基因表达的时空模式，Scaffold序列组装和遗传图谱，多色荧光原位杂交（FISH）研究
myTags原位杂交探针集，运用Arbor的技术设计制造，特异性高，无重复序列，可以轻松地增强信号并减少背景噪音，将目标区域可视化。myTags从设计到定制，为您提供灵活全面的原位杂交解决方案，探针数量、密度和标记方式均可灵活选择，满足各类型实验设计需求。
2022-10-09 14:44:57
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原创 myBaits Expert 16S-Hyb panel，利用16S rRNA基因的无扩增子靶向测序分析微生物群落，鉴别样本中微生物种类并定义微生物群落内关系（宏基因组学）
myBaits Expert 16S-Hyb Panel 运用杂交捕获技术，可以富集整个 16S 基因，而不仅仅是一两个高变区（hypervariable regions）。与 16S 扩增子测序相比，具有更好的分类分辨率和更少的偏差。此试剂盒结合宏基因组方法，还可以有效鉴别全新表型的稀有微生物，并降低单个样本的测序深度。
2022-09-15 16:52:24
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