CANCERLLM: A LARGE LANGUAGE MODEL IN CANCER DOMAIN

本文是LLM系列文章,针对《CANCERLLM: A LARGE LANGUAGE MODEL IN CANCER DOMAIN》的翻译。

CANCERLLM:癌症领域的大型语言模型

摘要

ClinicalCamel 70B、Llama3OpenBioLLM 70B 等医学大语言模型 (LLM) 在各种医学 NLP 任务中表现出了令人印象深刻的性能。然而,目前仍然缺乏专门针对癌症领域设计的大型语言模型(LLM)。此外,这些LLM通常有数十亿个参数,这使得它们对于医疗保健系统来说计算成本高昂。因此,在这项研究中,我们提出了 CancerLLM,一个具有 70 亿个参数和 Mistral 风格架构的模型,对涵盖 17 种癌症类型的 2,676,642 份临床记录和 515,524 份病理报告进行了预训练,然后对两项癌症相关任务进行了微调,包括癌症表型提取和癌症诊断生成。我们的评估表明,与其他现有的LLM相比,CancerLLM 取得了最先进的成果,平均 F1 分数提高了 7.61%。此外,CancerLLM 在两个拟议的稳健性测试平台上优于其他模型。这说明CancerLLM可以有效地应用于临床人工智能系统,增强癌症领域的临床研究和医疗保健服务。

1 引言

2 CANCERLLM

3 结果

4 讨论

5 结论

在这项研究中,我们引入了CancerLLM,这是专为癌症领域设计的医学LLM。我们提供了三个用于癌症表型提取、癌症诊断生成的数据集。此外,我们提出了两个测试平台来评估 CancerLLM 的稳健性。将 CancerLLM 与 14 个广泛使用的 LLM 进行比较,我们的结果表

当在 `parseRKNN` 时出现 `configSize large then model size` 问题,一般意味着配置信息的大小超出了模型本身的大小,可能由以下几种原因导致,对应的解决方法如下: ### 检查配置文件 配置文件可能包含了多余或者错误的信息,导致其大小异常。需要仔细检查配置文件,去除不必要的参数或者修正错误的参数设置。例如,检查配置文件中是否有重复的配置项或者错误的参数值。 ```python # 示例:检查配置文件的部分代码 import yaml try: with open('config.yaml', 'r') as f: config = yaml.safe_load(f) # 检查配置项 for key, value in config.items(): if key == 'unnecessary_key': del config[key] # 删除不必要的配置项 except FileNotFoundError: print("配置文件未找到") ``` ### 模型加载问题 模型文件可能损坏或者没有完整加载。需要重新下载或者拷贝模型文件,确保模型文件的完整性。同时,检查模型文件的路径是否正确。 ```python import os model_path = 'path/to/your/model.rknn' if not os.path.exists(model_path): print("模型文件不存在,请检查路径") else: # 可以尝试重新加载模型 try: # 这里假设使用 rknn 库加载模型 from rknn.api import RKNN rknn = RKNN() ret = rknn.load_rknn(model_path) if ret != 0: print("模型加载失败,请检查模型文件是否损坏") except ImportError: print("未找到 rknn 库,请安装") ``` ### 版本兼容性问题 使用的 RKNN 工具版本可能与模型不兼容。需要确认使用的 RKNN 工具版本与模型的版本一致。可以查看官方文档或者社区论坛,了解不同版本之间的兼容性信息。 ```bash # 示例:查看 RKNN 工具版本 rknn --version ``` ### 内存问题 系统内存不足可能导致配置信息无法正确加载。可以关闭一些不必要的程序或者服务,释放系统内存。同时,检查系统的内存使用情况,确保有足够的内存来加载模型和配置信息。 ```python import psutil # 查看系统内存使用情况 memory = psutil.virtual_memory() print(f"总内存: {memory.total / (1024 ** 3):.2f} GB") print(f"可用内存: {memory.available / (1024 ** 3):.2f} GB") if memory.available / memory.total < 0.1: print("系统内存不足,请关闭一些不必要的程序") ```
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