Shell单个或者批量提交高斯计算任务脚本及详解(g16/g09/g03版本)

本文详细介绍了如何在Linux环境中检查Gaussian软件(g16版本)的安装,创建并提交计算任务,以及如何通过编写shell脚本来批量处理多个输入文件。内容包括验证安装、编写输入文件、提交单个任务和批量任务的脚本,适用于化学和材料科学领域的量子计算研究。
摘要由CSDN通过智能技术生成

我的电脑安装的高斯版本为g16版,下面是基于该版本的提交,如果是其它版本请做对应的修改,只需要将其中关键词“g16”改成对应的版本即可,如改为“g09”或者“g03”。

1. 测试高斯是否已安装(安装方法请参考sobereva博文Gaussian的安装方法):

        在终端输入[room@localhost ~ ] $ g16

        如果出现下列字样,说明已经安装好g16版本高斯
         Entering Gaussian System, Link 0=g16:g16

2. 假设在终端当前文件下存在名为 test.gjf 的输入文件,文本内容如下,注意尾行需要空一行,否则会报错:

%nprocshared=6
%mem=2500MB
# opt b3lyp/3-21g* geom=connectivity

Title Card Required

0 1
 O                 -0.95826889   -0.45595053    0.00000000
 H                  0.00173111   -0.45595053    0.00000000
 H                 -1.27872348    0.44898530    0.00000000

 1 2 1.0 3 1.0
 2
 3

3. 提交上面任务(单个任务)

        直接使用命令:g16 test.gjf   &     (这时文件夹会生成一个test.log文件,即为

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