将vasp结构优化的每一步（XDATCAR文件）转化成POSCAR文件，通过VESTA实现可视化

vasp结构优化后，有时需要提取或者观察优化过程中的特定离子步的结构，可以通过该shell脚本实现，只需要在优化结构所在文件夹下运行下列脚本，即可将每一个离子步输出为POSCAR-x文件！

#!/bin/bash
#zhaoc_chem@126.com
sum_atoms=$(cat XDATCAR | sed -n '7p' | awk '{for (i=1;i<=NF;i++) sum+=$i; print sum}')
sum_steps=$(grep F= OSZICAR | awk '{print $1}')
for j in $sum_steps
do
awk '{if (NR<8) print $0}' XDATCAR > POSCAR-$j
grep -xA $sum_atoms "Direct configuration=   $j" XDATCAR >> POSCAR-$j
grep -xA $sum_atoms "Direct configuration=    $j" XDATCAR >> POSCAR-$j
grep -xA $sum_atoms "Direct configuration=     $j" XDATCAR >> POSCAR-$j
done

使用方法：

1.在优化结构的工作目录新建后缀为 .sh 文件(如 test.sh )，复制上面代码进文件保存退出

2.终端进入当前文件夹：cd ~/....../工作目录/

3.终端输入该命令授权脚本可执行：chmod 777 test.sh

4.终端输入：./test.sh

当前文件夹刷新即出现对应POSCAR文件，继而可以通过VESTA可视化(Download - VESTAhttp://www.jp-minerals.org/vesta/en/download.html)。