为什么基因组测序中reads尾部常见polyG

起因

熟悉使用fastp，该软件可对双端测序数据进行trim处理。其参数中有一项为trim_poly_g。过去常做RNA-seq，知道mRNA加工时会产生polyA尾，但DNA为什么会有polyG？感到困惑。

经过

google进行百度，意外得到了fastp作者对此问题的回答，进行理解和翻译如下结果。

结果

Nextseq和Novaseq（四年前，最新机器不确定）是双色系统，在双色系统中：

• 绿色 T
• 红色 C
• 黄色（红+绿） A
• 黑色（无红&无绿） G

而当互补配对合成逐轮进行，信号强度也逐渐减弱。当信号弱到不可测时，则会被错误检测为G。所以在reads末端常见polyG。