解析drugbank xml文件的代码。(先要把文件里的换行符删干净了)

本文档介绍如何处理和解析DrugBank的XML文件,强调在解析前需要删除文件内的换行符,以确保顺利进行代码解析。通过示例代码,详细解释了处理过程和关键步骤。
摘要由CSDN通过智能技术生成
# -*- coding: utf-8 -*-
"""
Created on Wed Dec  5 16:43:28 2018

@author: chealia
"""

import xlrd
from  xlutils.copy import copy
from xml.parsers.expat import ParserCreate

rb=xlrd.open_workbook(r'c:\users\chealia\201812\drug.xlsx')
wb=copy(rb)
global i
i=0
global j
j=0
global flag
flag=0
c1=wb.get_sheet(0)

class DefaultSaxHandler(object):
    def start_element(self,name,attrs):
        global i  #全局变量在使用前还要再声明一次,切记!
        global flag
        global j
        if i>65535:
            return
        if name=='drug' and flag==0:
            c1.write(i,0,attrs.get('type'))
            flag=0
            j=i #第j行就是第i行
            i=i+1 
            
        if name=='drugbank-id' and flag==0:            
            flag=1
        if name=='name' and flag==10:
      
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