浅谈DPABISurf数点理解

Volume空间的功能连接基本都明白了。
ROI to brain
定义一个ROI，做它与全脑的功能连接，那么取这个ROI的时间序列平均值，然后把这个平均值和全脑 体素做FC，这个ROI的值是1，其他体素的值就是相关性系数的值。这样我们就得到了全脑的R值。
统计的时候，把多个被试的全脑R值放进去，两组进行对比，每个体素的R值就会有多个被试那么多，所以经过统计，就能得到每个体素的t值。如下图：

（未完待续）
ROI与ROI的对比就更简单了。
取ROI_1的平均时间序列，取ROI_2的平均时间序列，把他们进行对比，就能得到一个R值。多个被试就有多个R值。作图的时候可以显示平均R值。
干预前后，就是把干预前多个R值和干预后多个R值进行对比，就得到了1个t值和p值，那么这个数就可以代表干预有没有显著性，是显著上升还是显著下降。
这个明白了，都可以用R语言去做置换检验计算。我推荐用置换检验，尤其是对十多个被试的小样本来说。当然，其实是t检验，置换都做，哪个有结果用哪个。
ROI to ROI是不用多重校正的，因为只有1to1，如果是3个ROI，那就要两两比较的多重校正，这都符合统计常识。

DPABISurf
皮层的计算，其实原理和Volume差不太多。不同的一点是，多了一步，就是把Volume的体素投射到重建的皮层上，所以这个时候根据角度啥的，相应的把体素值给分解，然后贴到皮层上，简单理解就是：还是体素值，但是坐标系不同。
因此计算皮层的功能连接，比如定义一个ROI，给出坐标，那么这个ROI就是在皮层坐标上，然后取ROI的平均时间序列，去做FC，后面都是一样的操作，然后计算以后，把t值透射到皮层去。
皮层的结构像用fsaverage这个皮层空间坐标，皮层的功能像用fsaverage5这个皮层空间坐标。fsaverage5和MNI，这两个空间坐标需要记住。

今天遇到dparsf的报错，有点无语。
报错信息：XXX is not defined for values of class matlab.ui.figure。
报错了3次，很烦，后来排查。
解决方法：其实就是点run的时候，不能停留在dparsf的界面，需要点一下matlab的界面，回到matlab的command window。
原理：如果不回到command window去，那么check picture的时候，没办法自动跳过，就卡bug了，后续的reho，FC分析就会停止。只有回到window窗口，check picture才能自动跳过。

发这篇文，主要是为了记录这一个报错，附带着说一下皮层分析的原理，皮层肯定是更精细的，是趋势所在，所以明白理解了volume以后，还是需要早日进入surface空间去分析。