北鲲云超算平台助力基因检测

“核酸的保质期,都比不过一块面包”

最近几个月的深圳人已经把 48/72 小时核酸刻在了骨子里,相信刚刚解封的上海人也即将有同样的感受,毕竟核酸不到位,地铁公交还有公共场所哪哪都去不了。

可是核酸也不是每次都能定期出来的呀。

小鲲就因为核酸结果没有及时出来在高铁站门口吹了3个小时的凉风!!

在这3个小时,小鲲疯狂搜查核酸相关内容,找到了一些核酸检测中可能出现的“意外”。

帮大家简单地提炼了一下,内容都在图里了!

在这里插入图片描述

好家伙,等核酸等出素材来了啊!

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是这样的,我们平时做的核酸检测(大规模筛查)只是一种简单的定量检测,叫荧光定量PCR。单单这个环节并不涉及到云计算。

而在流行病学调查中,我们需要通过分析序列差异来寻找传播途径和来源,想要知道具体序列,就要进行基因测序。

基因测序可不就是我们的老朋友了!

基因测序短时间内就能够产出PB级的海量数据,因此只有通过更高性能的服务器与更快速的分析算法,才能满足里面大量且多样化的数据需求。快速精准的结果一定是基于庞大的计算数据。

算力不足、存储需求大、部署困难等种种因素都成了影响基因测序效率的因素。

这已经变成了“算力”的比拼。

作为Cloud-HPC的先行者,北鲲云面向不同行业,不同场景的业务需求,为用户提供SaaS、混合和私有化等多种业务模式。在基因行业,北鲲云也充分发挥自身在HPC、存储和数据安全方面等优势,根据不同场景为用户量身定制解决方案。

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在我们过往和客户合作的经验中了解到,大型基因测序机构动辄涉及到数万/数十万个基因测序及模型建立,依赖大量的计算和存储资源,随着业务量的进一步扩展,传统IT架构定将面临以下挑战:

在使用峰值时,任务需要排队等候。

 由于基因测序对算力的需求是波动的,这会导致服务器的数量无法得到很好的控制。如果选择采购可以满足最大峰值的集群,那么在业务量不能时刻保持高峰时,就会存在很大的成本浪费。而一旦服务器不足,则无法满足业务高峰时的测序任务。

在各个测序分析的阶段需要借助不同规格的计算资源,线下计算集群往往无法适应快速的扩缩容。

在此场景,北鲲云解决方案如下:

  • 整合本地服务器资源和云上资源

    当测序需要大量资源时,平台能够在多地域、多云厂商中调度海量的计算资源,保障大规模测序工作的稳定运行;在业务低谷时,可以释放资源,降低成本。在不同的测序分析阶段,北鲲云都能为测序企业提供不同规格的计算资源。

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我们接触到的小规模医疗机构所产生的基因检测数据量通常较小,很少去专门构建本地HPC和进行运维,因为这其中的成本相当高。

在此场景,北鲲云解决方案如下:

  • 丰富且充足的计算资源,按需使用,弹性计费。

    全方面的数据安全保护

    专业HPC技术服务团队,7*24小时及时响应

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对基因测序行业来说,上“云”已成为数字生命时代势在必行的举措,在未来生物技术发展与云计算的共同推动下,基因测序必然会造福更多的人类。

在这条生命科学的漫漫征程中,北鲲云将紧跟科技的发展和用户需求的变化,持续进行研发迭代升级,伴随基因产业一路前行!

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