常用的linux基础命令

mkdir

mkdir mydata #创建mydata的目录

rm

touch hehe.txt #创建一个hehe.txt的新文件
rm hehe.txt #删掉hehe.txt文件
rm -r mydata #加-r参数，删掉mydata的目录文件

vi/vim的基本操作

which

which命令用于查看可执行文件的位置。
which指令会在环境变量$PATH设置的目录里查找符合条件的文件。
也就是说，使用which命令，就可以看到某个系统命令是否存在，以及执行的到底是哪一个位置的命令。
我一般用来查找软件的执行路径,但是只打印第一个，要打印所有的需要加-a参数

$ which R
/usr/bin/R
#-all, -a	Print all matching executables in PATH, not just the first.
$ which -a R
/usr/bin/R
~/software/.soft/R

locate

locate 配合数据库查看文件位置。

find

ls

$ ls
rnaseq_tp53  task1-人类基因组外显子区域长度  task2  task4
$ ll -thr
总用量 0
drwxrwxr-x. 3 zhengzx zhengzx 244 9月   8 09:01 task1-人类基因组外显子区域长度
drwxrwxr-x. 4 zhengzx zhengzx  85 9月   8 14:11 task2
drwxrwxr-x  2 zhengzx zhengzx  81 9月  23 14:34 task4
drwxrwxr-x  2 zhengzx zhengzx 282 9月  23 16:15 rnaseq_tp53

pwd

$ pwd
/home/zhengzx #得到当前目录下的绝对路径

man-非常有用的命令

man ls 查看ls的帮助文档

cd

cd #切回到家目录
cd -	#回到上次的路径下
cd ..	#切换到上一层目录
cd dir #切换到dir路径下

mv

rename #重命名

cp；scp/rsync

sort;uniq

head/tail;cat

less

less -SN

压缩/解压缩

gzip file
tar

下载

wget;

软链接

ln -s

本地上传下载

sz/rz

效率神器

grep/sed/awk/cut