蛋白质致病突变的计算方法(六)

最新推荐文章于 2025-05-15 14:07:28 发布

李划水员

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分类专栏：蛋白质基础文章标签：笔记

本文链接：https://blog.csdn.net/Daisy4/article/details/138183419

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本文探讨了致病热点残基在蛋白质突变与疾病关联中的重要性，如BRCA1/2、BRAF、TP53和EGFR等基因中的热点位点，以及如何通过分子模拟和数据库工具预测这些热点。研究还揭示了热点残基在肺癌和信号转导中的关键作用及其在药物靶点选择中的价值。

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5. 致病热点残基鉴定

致病热点残基是蛋白质中特定的氨基酸位置，在突变时可导致疾病的发生。识别这些热点残基是了解疾病进展机制和开发潜在治疗策略的重要一步。Takeuchi 等人在BRCA1和BRCA2基因中发现了热点残基，它们与乳腺癌风险增加有关。Chang等人在41种癌症类型中确定了470个体细胞突变热点，这些突变热点似乎会影响各自蛋白质的分子功能。其他用于热点残基的重要数据库和服务器包括HotMAPS、HotSpoAnnotations 、HotSpot3D 、Mutation3D ，它们用于识别癌症中的突变簇。

5.1 肺癌中的热点残留物

肺癌包括（comprises）两种主要类型，如肺鳞状癌(LUSC)和肺腺癌(LUAD)。Pandey & Gromiha系统地分析了195种蛋白质中的4172个疾病易感位点，并与4137个中性位点的突变频率进行了比较。他们发现，Glu、Gly、Gln、Asp和Trp在易患病部位更受青睐，而中性部位富含Ile、Lys、Val、Asn和Phe。

Qin 等人对BRAF进行突变扫描实验，发现BRAF活性位点的F468、D594、F595和V600对信号转导至关重要。Kotoula等人鉴定T598和S601为BRAF蛋白磷酸化的重要位点。此外，TP53 DNA结合域的R244、G245、R248、R249、R273和R282位点的突变会影响TP53的结构和功能，并与癌症有关。Liang等在EGFR、BRCA2中的W993、F890、Y2624、TP53中的G154、I254、V218以及FAT4中的K2930、R1585、S3427、S3112、P1662中确定了T790、L858为必需位点。