MRI 深度串联网络代码

问题汇总

1、论文：A Deep Cascade of Convolutional Neural Networks for MR Image Reconstruction
2、github: https://github.com/js3611/Deep-MRI-Reconstruction

由于版本问题，代码执行问题非常之多，先备忘如下：
按照作者requirements的要求，使用anaconda依次下载。
（1）虽然使用conda install -c toli lasagne (https://anaconda.org/toli/lasagne)试图下载v0.2.dev1.toli但是貌似这个版本不对，因为还使用了downsample等过时的包，编译的时候发现和0.9.0以及以上的theano无法兼容。这里直接去github上找，参看解决方案：https://stackoverflow.com/questions/39501152/importerror-no-module-named-downsample，注意这里改代码这个方案是有问题，还是直接pip下比较好。
（2）一般来讲使用conda按照总能装到0.7.5的pygpu和1.0.1的theano，这里最好指定版本。而且我发现0.7.5+1.0.1可以使用，而0.6.5+0.9.0也可以使用。然而0.6.5pygpu却难以在清华源下到，这里要直接conda install -c conda-forge pygpu=0.6.5。其他版本的pygpu和theano都有问题，这个requirements 没有指出。
（3）剩下就是按照cuda和cudnn，这个版本问题requirements 没有提到，而在theano官网提到一些，然而遗憾的是在代码运行时仍然有严重问题。
->cudnn7.1+cuda9.0，最新的版本，这个错误非常奇怪，error getting worksize: CUDNN_STATUS_BAD_PARAM，反正目前还不知道什么原因。
->cudnn5.0+cuda8.0,这个错误及其难排除，因为根本不报错，在代码执行到theano中的function_module.py的self.fn() if output_subset is None else\（884行）时，代码在GPU内死掉，没有反馈，程序停在那里不动了。这个GPU调试怎么做啊？
->cudnn6.0+cuda8.0,直接运行，没有任何问题…

NOTE:
我是按照requirements的0.9.0 theano执行的，因此用cudnn6.0会提示cudnn版本过高，不过目前没什么错误。
执行程序时一定要换到anaconda里面的python环境中。（用source activate ‘python版本名字’）
如果碰到诸如pygpu没法初始化或者no property named version等待，一般都是pygpu版本没对应上theano版本。
网址http://deeplearning.net/software/theano_versions/dev/install_ubuntu.html 会推荐用mila-udem去装pygpu，可能也要指定版本。
千万不要试图换到theano 0.8.0或者更低版本，他们貌似要更低的cudnn和cuda版本才能支持。
以上问题全部是试图用GPU跑该代码出现的，CPU无所谓了。