conda中deepmd 使用

最新推荐文章于 2024-07-05 09:20:51 发布
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文章标签： java 前端 服务器
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1.转化outcar文件

python中pip install deepmd 安装deepmd

import dpdata

dpdata.LabeledSystem('OUTCAR').to('deepmd/npy', 'data', set_size=200)

2.开始训练

dp train input.json

3.冻结

dp freeze -o graph.pb

4.压缩

dp compress -i graph.pb -o graph-compress.pb

(｡･∀･)ﾉﾞ嗨！嗨嗨嗨
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也就是要按照我上面的顺序来 按e键后，要再按i键后再进行粘贴，确保显示了export而非rt。1、老板让装一下DeepMD，说是今后会用到，然后我开始再在网上找教程开始装了，完全新手上路。（当然不同人路径不一样）” 我始终实现不了，小白第一次接触，后来去学了vim编辑器的使用方法。常用的几个操作：首先E键进入编辑，然后i键进入编辑模式 显示插入，这个时候就可以修改了。修改完后，Esc键退出编辑模式，在输入:wq命令回车后即可实现保存后退出。然后再设置环境变量那里卡了很久。原帖中：编辑profile。
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数据集的量有500-2000不等，当然数据集越多训练的越好。除此之外还有体系的原子数，同样原子数越多训练的越好。本文中通过VASP进行MD动力学过程，运行1000步，随机抽取200个数据集作为测试集，800个数据集作为训练集。02.lmp.将vasp运行的OUTCAR复制到00.data中，运行如下python代码进行数据集的划分。a:VASP运行需要4个文件：POSCAR，POTCAR，KPOINTS，INCAR。大概流程就这么多，有不清楚的地方，欢迎关注公众号：硕博科研小助手，联系我。
conda中使用linux命令
08-01
在conda中使用Linux命令的方法是通过在终端或命令提示符中运行命令。conda本身并不提供所有的Linux命令，但它可以与Linux命令一起使用。例如，你可以使用conda安装Linux命令所需的软件包，然后在终端中运行这些命令。 要在conda中使用Linux命令，首先需要确保你已经安装了所需的软件包。你可以使用conda安装这些软件包，或者使用系统的包管理器安装它们。一旦安装了所需的软件包，你就可以在终端中直接运行Linux命令。 举个例子，如果你想在conda环境中使用Linux的ls命令来列出当前目录的文件和文件夹，你可以在终端中运行以下命令： ``` ls ``` 这将显示当前目录中的文件和文件夹。 需要注意的是，conda环境中的Linux命令可能与系统中的命令有所不同，具体取决于你安装的软件包和配置。因此，建议在使用Linux命令之前，先查阅相关文档或使用命令的帮助选项来了解其在conda环境中的使用方式。 总结起来，要在conda中使用Linux命令，你需要先安装所需的软件包，然后在终端中直接运行这些命令。
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