图神经网络基准测试(Benchmarking Graph Neural Networks)项目指南

图神经网络基准测试(Benchmarking Graph Neural Networks)项目指南

benchmarking-gnns 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/be/benchmarking-gnns

项目概述

本项目来源于graphdeeplearning/benchmarking-gnns，旨在为图神经网络（GNNs）提供一个全面的基准测试环境。它支持多种数据集和框架版本，帮助研究者和开发者评估其图深度学习模型的性能。当前项目基于DGL库的0.6.1及以上版本，并且提供了详尽的实验报告和技术文档。

目录结构及介绍

基准测试项目采用清晰的组织结构，便于开发者快速定位所需资源：

• configs: 包含了用于设置实验环境的配置文件，如CPU和GPU的不同运行环境。
• data: 存放各种图形数据集，是进行图神经网络训练和测试的数据来源。
• docs: 文档资料，可能包括项目介绍、API参考等。
• layers: 定义自定义的图神经网络层。
• nets: 实现具体的图神经网络模型架构，比如MP-GCN、WL-GNN等。
• scripts: 启动脚本和辅助工具，用于执行不同任务，如数据下载、模型训练等。
• train: 训练相关代码，通常包含模型训练的具体逻辑。
• utils: 辅助函数集合，用于数据预处理、模型评估等通用功能。
• visualization: 可视化工具或代码，用于展示结果或模型行为。
• .gitignore, LICENSE, README.md: 分别是Git忽略文件、软件许可证和项目简介。
• 环境配置文件(environment_cpu.yml, environment_gpu.yml): 针对CPU和GPU环境的依赖项配置。

项目启动文件介绍

• 主入口脚本往往位于scripts目录下，或直接在根目录有main_*.py文件，如main_SBMs_node_classification.py。这些脚本提供了一个简单的命令行接口来运行特定的实验，如节点分类任务在SBM图上的应用。
• Jupyter Notebooks（如main_COLLAB_edge_classification.ipynb）也是常用启动点，适合逐步探索和调试。

项目的配置文件介绍

配置文件主要存在于configs目录中，通过YAML格式存储：

• 环境配置：environment_cpu.yml和environment_gpu.yml分别针对CPU和GPU环境设定必要的Python包及其版本。
• 实验配置：项目内可能还有专门的配置文件，用于控制每个实验的细节，如数据路径、模型参数、优化器设置等。它们允许用户微调实验而无需修改核心代码。

使用指引简述

1. 安装: 根据提供的环境配置文件，设置相应的Python环境。
2. 下载数据: 按照文档指示下载并准备数据集。
3. 配置: 调整配置文件以匹配你的实验需求。
4. 运行: 使用指定的脚本或Notebook开始实验，确保正确指向配置文件和数据路径。

通过遵循上述指导，您可以有效地利用此项目来评估和比较不同的图神经网络模型性能。记得查阅项目README.md获取最新信息和更详细的步骤。

benchmarking-gnns 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/be/benchmarking-gnns