Squidpy 项目教程

Squidpy 项目教程

squidpySpatial Single Cell Analysis in Python项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/squ/squidpy

项目的目录结构及介绍

Squidpy 是一个用于空间单细胞分析的 Python 工具。以下是项目的目录结构及其介绍：

• docs/: 包含项目的文档文件。
• src/squidpy/: 包含 Squidpy 的主要源代码。
• tests/: 包含项目的测试代码。
• scripts/ci/: 包含持续集成脚本。
• bumpversion.cfg: 版本 bump 配置文件。
• cruft.json: 项目模板配置文件。
• editorconfig: 编辑器配置文件。
• gitignore: Git 忽略文件配置。
• gitmodules: Git 子模块配置。
• mypy.ini: Mypy 静态类型检查配置。
• pre-commit-config.yaml: 预提交钩子配置。
• prettierignore: Prettier 忽略文件配置。
• readthedocs.yml: Read the Docs 配置文件。
• CONTRIBUTING.rst: 贡献指南。
• LICENSE: 项目许可证。
• MANIFEST.in: 清单文件。
• README.rst: 项目介绍文档。
• README_pypi.rst: PyPI 介绍文档。
• pyproject.toml: Python 项目配置文件。
• tox.ini: Tox 配置文件。

项目的启动文件介绍

Squidpy 项目的启动文件位于 src/squidpy/ 目录下。具体启动文件可能包括 __init__.py 和其他核心模块文件。这些文件负责初始化项目并提供主要功能。

项目的配置文件介绍

Squidpy 项目的配置文件包括：

• bumpversion.cfg: 用于版本管理的配置文件。
• cruft.json: 项目模板配置文件。
• editorconfig: 编辑器配置文件，用于统一代码风格。
• gitignore: Git 忽略文件配置，指定哪些文件不纳入版本控制。
• gitmodules: Git 子模块配置，用于管理外部依赖。
• mypy.ini: Mypy 静态类型检查配置，确保代码类型安全。
• pre-commit-config.yaml: 预提交钩子配置，用于自动化代码检查和格式化。
• prettierignore: Prettier 忽略文件配置，指定哪些文件不进行格式化。
• readthedocs.yml: Read the Docs 配置文件，用于文档构建和部署。
• pyproject.toml: Python 项目配置文件，包含项目依赖和其他构建配置。
• tox.ini: Tox 配置文件，用于自动化测试和环境管理。

以上是 Squidpy 项目的主要目录结构、启动文件和配置文件的介绍。希望这些信息能帮助你更好地理解和使用 Squidpy 项目。

squidpySpatial Single Cell Analysis in Python项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/squ/squidpy