非root权限安装python+HTSeq+numpy+easy_install

1.直接非root权限安装一个python

首先在软件列表文件夹下 

mkdir python-2.7

cd python-2.7

下载python-2.7.10 传至当前文件夹

cd python-2.7.10

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1. ./configure --prefix=/lustre/user/zhangjia/software/python-2.7  

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1. make  
2. make install  

然后就会在python-2.7这个文件下面生成目录bin

修改.bashrc文件

添加:

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1. PYTHONDIR=/lustre/user/zhangjia/software/python-2.7/bin  
2. export PATH=$PYTHONDIR:$PATH  

执行.bashrc  

source  和 .  是一样的

安装成功，现在python是自己的。

2.安装easy_install

下载ez_setup.py

然后python ez_setup.py build

提示https://pypi.python.org/packages/source/s/setuptools/setuptools-8.0.4.zip这个setuptools没下到，不知道是不是超算联网的原因。直接打开这个网页，下载好setuptools-8.0.4.zip 没解压放到python-2.7文件夹下面。

重新执行 python ez_setup.py build

OK!

python ez_setup.py install

安装在自己的python下面。出现了easy_install

然而，试了下 

easy_install numpy  并没有成功，easy_install放着不动。

3.安装pip

下载pip

解压pip包

安装： python setuppy install

安装完后，可在python2.7/bin下找到pip

4.安装numpy

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1. pip install numpy  

5.安装HTSeq

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1. pip install HTSeq 
   

python-2.7/bin下出现了htseq-count 和 htseq-qa