多元统计分析——数据降维——Fisher线性判别分析(LDA)

一、LDA的思想

Fisher线性判别分析(Fisher's Linear Discriminant Analysis, 以下简称LDA)是一种有监督学习的降维技术,也就是说它的数据集的每个样本是有类别输出的。这点和PCA不同。PCA是不考虑样本类别输出的无监督降维技术。LDA的思想可以用一句话概括,就是“投影后类内方差最小,类间方差最大”。通俗理解就是:将数据在低维度上进行投影,投影后希望每一种类别数据的投影点尽可能的接近,而不同类别的数据的类别中心之间的距离尽可能的大,如下图所示。

只所以称为线性判别分析,其实是因为其最早用在分类当中:判别分析是寻找一种“分类规则”,即利用变量的函数(判别函数)来描述(解释)两组或多组之间的区别。

例如对于银行来说,最重要的是判断申请者是否能够成功还款,以此作为是否给其贷款的依据。判别分析即利用历史数据(成功还款和未偿还贷款),通过两类人的一些有区别的特征(年龄、收入等),找到一个“最优”的规则区分这两类人。

二、二类LDA原理

1、原理

上面我们已经知道,Fisher线性判别分析的思想是寻找两个群体“最好”的线性判别法则,来最大限度的区分两个群体。从几何角度上理解,其实也就是找到一个最佳的投影线(定义为a),使其在该投影线上的投影最大限度的分开,对于该投影线,我们只要找到其方向就可以了。如下图所示:

我们假设有两个群体,总体均值向量\mu _{1}\neq \mu _{2},但具有相同的协防差矩阵\Sigma

从中抽取两个随机样本:

第一个p维样本y_{11}......y_{1n}的样本均值向量为\overline{y}_{1},则样本的协方差矩阵为\frac{\Sigma }{n_{1}}

第二个p维样本y_{21}......y_{2n}的样本均值向量为\overline{y}_{2},则样本的协方差矩阵为\frac{\Sigma }{n_{2}}

类似于两样本的t检验,我们比较两个群体,只要比较两个群体的均值即可。这里也是,我们只要使得原始均值向量\overline{y}_{1},\overline{y}_{2}a上的投影距离最大(下图黄线的长度)即可。

由线性代数我们知道:如果a为单位向量,{a}'y即为ya方向上的投影向量长度。\overline{y}_{1}a方向上的投影向量长度我们可以表示为:\overline{Z}_{1}={a}'\overline{y}_{1}\overline{y}_{2}a方向上的投影向量长度表示为:\overline{Z}_{2}={a}'\overline{y}_{2},两投影的距离为d=\overline{Z}_{1}-\overline{Z}_{2}={a}'\overline{y}_{1}-{a}'\overline{y}_{2},即我们的目的:找到一个a,使得d=\overline{Z}_{1}-\overline{Z}_{2}={a}'\overline{y}_{1}-{a}'\overline{y}_{2}最大。

上面 d=\overline{Z}_{1}-\overline{Z}_{2}={a}'\overline{y}_{1}-{a}'\overline{y}_{2},我们衡量的是欧式距离,我们知道欧式距离的缺陷在于:1、欧式距离易受变量不同量纲的影响;2、没有考虑变量之间的相关性。

关于欧式距离和马氏距离的区别可参考:《多元统计分析——欧式距离和马氏距离

我们知道:马氏距离即是我们将向量“标准化”过后的欧式距离,如何标准化,即乘上向量其自身的协防差矩阵的逆的矩阵根

{a}'\overline{y}_{1}-{a}'\overline{y}_{2}的协方差矩阵cov(a'(\overline{y_{1}}-\overline{y_{2}})) =[a'(\overline{y_{1}}-\overline{y_{2}})][a'(\overline{y_{1}}-\overline{y_{2}})]'=a'(\overline{y_{1}}-\overline{y_{2}})(\overline{y_{1}}-\overline{y_{2}})'a

其中(\overline{y_{1}}-\overline{y_{2}})(\overline{y_{1}}-\overline{y_{2}})'=cov(\overline{y_{1}}-\overline{y_{2}})=\frac{\Sigma }{n_{1}}+\frac{\Sigma }{n_{2}}=\Sigma(\frac{1 }{n_{1}}+\frac{1}{n_{2}}),由上面的假设我们已知两总体是具有相同的协方差矩阵\Sigma,借助t检验中的“两均值之差的方差等于两均值方差的之和”的思想,我们知道多元统计分析同样具有这样的性质:cov(\overline{y_{1}}-\overline{y_{2}})=cov(\overline{y_{1}})+cov(\overline{y_{2}})=\frac{\Sigma }{n_{1}}+\frac{\Sigma }{n_{2}}

(\overline{y_{1}}-\overline{y_{2}})(\overline{y_{1}}-\overline{y_{2}})=\Sigma(\frac{1 }{n_{1}}+\frac{1}{n_{2}})代入到a'(\overline{y_{1}}-\overline{y_{2}})(\overline{y_{1}}-\overline{y_{2}})'a,可得{a}'\overline{y}_{1}-{a}'\overline{y}_{2}的协方差矩阵cov(a'(\overline{y_{1}}-\overline{y_{2}}))=a'\Sigma(\frac{1 }{n_{1}}+\frac{1}{n_{2}})a=(\frac{1 }{n_{1}}+\frac{1}{n_{2}})a'\Sigma a

{a}'\overline{y}_{1}-{a}'\overline{y}_{2}“标准化过后”的马氏距离为:[(\frac{1 }{n_{1}}+\frac{1}{n_{2}})a'\Sigma a]^{-\frac{1}{2}}[{a}'\overline{y}_{1}-{a}'\overline{y}_{2}],化简得\frac{​{a}'(\overline{y}_{1}-\overline{y}_{2})}{\sqrt{(\frac{1 }{n_{1}}+\frac{1}{n_{2}})a'\Sigma a}}

总体的协方差矩阵\Sigma我们一般是未知的,我们一般以样本的协方差矩阵S_{pl}代替,得\frac{​{a}'(\overline{y}_{1}-\overline{y}_{2})}{\sqrt{(\frac{1 }{n_{1}}+\frac{1}{n_{2}})a'S_{pl} a}}

为了避免负数的出现,我们对马氏距离加上一个平方,则投影后马氏距离的平方,我们定义成t^{2}(a)

t^{2}(a)=\frac{[{a}'(\overline{y}_{1}-\overline{y}_{2})]^{2}}{(\frac{1 }{n_{1}}+\frac{1}{n_{2}})a'S_{pl} a}\propto \frac{[{a}'(\overline{y}_{1}-\overline{y}_{2})]^{2}}{a'S_{pl} a}

Fisher线性判别分析的思想即为找到一个a使得t^{2}(a)最大,由于\frac{1 }{n_{1}}+\frac{1}{n_{2}}t^{2}(a)求极值无影响,可去掉。

2、利用柯西不等式求最大值

由上面我们已知:寻找两个群体“最好”的线性判别法则问题转换为求t^{2}(a)\propto \frac{[{a}'(\overline{y}_{1}-\overline{y}_{2})]^{2}}{a'S_{pl} a}极值得问题。

我们知道柯西不等式的一般表示式为:(a'b)^{2}\leq (a'a)(b'b),当a=b时取等。

我们令a=W^{\frac{1}{2}}ab=W^{-\frac{1}{2}}b,则不等式左边变成:[(W^{\frac{1}{2}}a)'(W^{-\frac{1}{2}}b)]^{2}=[a'(W^{\frac{1}{2}})'W^{-\frac{1}{2}}b]^{2}=(a'b)^{2},不等式右边变成[(W^{\frac{1}{2}}a)'W^{\frac{1}{2}}a][(W^{-\frac{1}{2}}b)'W^{-\frac{1}{2}}b]=[a'(W^{\frac{1}{2}})'W^{\frac{1}{2}}a][b'(W^{-\frac{1}{2}})'W^{-\frac{1}{2}}b]=(a'Wa)(b'W^{-1}b),组成变形后的柯西不等式为:(a'b)^{2}\leq(a'Wa)(b'W^{-1}b),当W^{\frac{1}{2}}a=W^{-\frac{1}{2}}b时取等。

(a'b)^{2}\leq(a'Wa)(b'W^{-1}b)可继续变形为\frac{(a'b)^{2}}{a'Wa}\leq b'W^{-1}b,取等条件可以变形为:a=W^{-\frac{1}{2}}W^{-\frac{1}{2}}b=W^{-1}b

关于柯西不等式可参考:《线性代数——柯西不等式

参考柯西不等式:\frac{(a'b)^{2}}{a'Wa}\leq b'W^{-1}ba=W^{-1}b时取等,我们可以求t^{2}(a)\propto \frac{[{a}'(\overline{y}_{1}-\overline{y}_{2})]^{2}}{a'S_{pl} a}的极值条件,即为a=S_{pl}^{-1}(\overline{y}_{1}-\overline{y}_{2})时,t^{2}(a)取最大值。

其中,a=S_{pl}^{-1}(\overline{y}_{1}-\overline{y}_{2})被称为判别函数系数a'y被称为Fisher判别函数。

3、案例

有两个样本数据,有两个维度进行刻画,已知第一个样本\overline{y}_{1}=\begin{pmatrix} 36.4\\ 62.6 \end{pmatrix},第二个样本\overline{y}_{2}=\begin{pmatrix} 39.0\\ 60.4 \end{pmatrix},协方差矩阵S_{pl}=\begin{pmatrix} 7.92 & 5.68\\ 5.68 & 6.29 \end{pmatrix},样本数据分布如下:

 如果这些点投影到y_{1}轴或者y_{2}轴,会有较大的重叠,在单个维度上,我们可以用t检验进行检验:

y_{1}轴上:t_{1}=\frac{\overline{y}_{11}-\overline{y}_{21}}{\sqrt{s_{11}(1/n_{1}+1/n_{2})}}=\frac{36.4-39.0}{\sqrt{7.92(1/5+1/7)}}=-1.58

y_{2}轴上:t_{2}=\frac{\overline{y}_{12}-\overline{y}_{22}}{\sqrt{s_{22}(1/n_{1}+1/n_{2})}}=\frac{62.6-60.4}{\sqrt{6.29(1/5+1/7)}}=1.48

双侧检验t_{\alpha /2}(10)=2.23(显著性水平\alpha =0.05),即两样本在单个维度上的差别不显著。

但是,我们还是可以很好的将其分开,如下图:

 利用上面知识,可计算出判别函数系数a=S_{pl}^{-1}(\overline{y}_{1}-\overline{y}_{2})=\begin{pmatrix} -1.633\\ 1.820 \end{pmatrix},判别函数Z=a'y=-1.6333Y_{1}+1.820Y_{2}

其中Y_{1}Y_{2}分别代表了样本两个维度的数据,我们将原始数据代入到判别函数Z,算出来的Z即为降维过后的数据(点在a上的投影坐标),即实现了原来二维的数据降到一维。

注意:Z=a'y=-1.6333Y_{1}+1.820Y_{2}中,系数代表每个变量对区分规则的贡献,如果变量的量级差别较大,我们可以先进行标准化处理再进行判别分析。

三、多类LDA原理

1、原理

现有g个群体G_{k}k=1,....,g,第k个群体样本为y_{k1},......,y_{kn_{k}},其中n_{k}代表第第k个群体的样本容量,第k个群体的样本均值为\overline{y}_{k},所有群体的样本均值为\overline{y}=\frac{1}{g}\sum ^{g}_{k=1}\overline{y}_{k}

借助简单统计学中的方差分析的思想:

如果各个群体均数相等,F的数值不会太大(在1的左右不会太远)。相反,如果的数值过大,“各个群体均数相等”这个假设就值得怀疑了。 

关于方差分析可参考:《统计推断——假设检验——方差分析

而LDA的思想可以用一句话概括,就是“经过a投影后组内方差最小,组间方差最大”,当然这个a就可能有多个了。

组间平方和为:

SSG=\sum ^{g}_{k=1}n_{k}(a'\overline{y}_{k}-a'\overline{y})^{2}=a'[\sum ^{g}_{k=1}n_{k}(\overline{y}_{k}-\overline{y})'(\overline{y}_{k}-\overline{y})]a,我们令\sum ^{g}_{k=1}n_{k}(\overline{y}_{k}-\overline{y})'(\overline{y}_{k}-\overline{y})=B,得到:

SSG=a'BaB代表原始样本数据的组间方差矩阵。

组内平方和为:

SSE=\sum ^{g}_{k=1}\sum ^{n_{k}}_{i=1}(a'y_{ki}-a'\overline{y}_{k})^{2}=a'[\sum ^{g}_{k=1}\sum ^{n_{k}}_{i=1}(y_{ki}-\overline{y}_{k})'(y_{ki}-\overline{y}_{k})]a,我们令\sum ^{g}_{k=1}\sum ^{n_{k}}_{i=1}(y_{ki}-\overline{y}_{k})'(y_{ki}-\overline{y}_{k})=W,得到:

SSE=a'WaW代表原始样本数据的组内方差矩阵。

F=\frac{SSG/g-1}{SSE/n-g}=\frac{n-g}{g-1}\cdot \frac{a'Ba}{a'Wa},如果g组均值有显著差异,则F数值充分大。

\frac{n-g}{g-1}对求极值无影响,则可以去掉,故我们应求令\frac{a'Ba}{a'Wa}最大化时的a值。

\frac{a'Ba}{a'Wa}这一表达在数学物理中被称为广义瑞利熵,关于广义瑞利熵的概念和应用大家可以自己查阅相关资料。我们这边直接应用性质进行\frac{a'Ba}{a'Wa}最大化的求解。

最大化瑞利熵的必要条件是:存在一个向量W使得Ba=\lambda Wa,稍微变形一下:W^{-1}Ba=\lambda a,这个正好就是我们对特征值和特征向量的定义一致,即\lambda是方阵W^{-1}B的特征值,a为方阵W^{-1}B\lambda为特征值对应的特征向量。即求F数值得最大化问题转换为求W^{-1}B的特征根问题。

2、LDA算法流程

以下是LDA算法的大致流程:

  • 计算组间方差矩阵B=\sum ^{g}_{k=1}n_{k}(\overline{y}_{k}-\overline{y})'(\overline{y}_{k}-\overline{y})
  • 计算组内方差矩阵W=\sum ^{g}_{k=1}\sum ^{n_{k}}_{i=1}(y_{ki}-\overline{y}_{k})'(y_{ki}-\overline{y}_{k})
  • 计算矩阵W^{-1}B
  • 计算W^{-1}B的特征值\lambda _{1}\lambda _{2},....,\lambda _{s}以及对应的特征向量e_{1}e_{2},...,e_{s}
  • 将特征值\lambda _{1}\lambda _{2},....,\lambda _{s}按照从大到小的顺序排列,选择非零特征值及对应的特征向量(s\leq min(g-1,p)g代表组数,p代表样本数据维度,如原始数据是3个组群,5个维度的数据,则非零特征值最多为2个),注意:非零特征值的意思是抛弃无限接近0的特征值,可通过特征值的占比来筛选特征值。
  • 将样本Y投影到新的空间Z,即得到了LDA降维后的结果。
  • ***计算Fisher判别函数:Z={a}'Y={e_{s}}'Y,其中Y根据数据维度可分解为\left [ y_{1},y_{2},...,y_{p} \right ],注意:输出的判别函数即为分类的规则,有多少个特征向量e_{s},就有多少个判别式****。 

注意:1、上面第四步所说的非零特征值其实是特征值无限接近0的特征值,即特征值占总特征值之和的占比很小。

           2、第七步中计算Fisher判别函数,是多元统计分析用于刻画分类规则而产生的,如果单纯为了实现降维,可跳过这一步。

3、案例

科考人员从加利福尼亚的砂岩中收集了原油样本。数据集地址:案例数据集《多元统计分析-数据降维-Fisher线性判别分析(LDA)-原油样本》。这些原油分别来自三类地层(3个类别)中的一类:

现试图基于砂岩中五种化学成分含量(5个维度),找到一种划分地层类别的方法 

数据样本如下:

使用pairplot()函数可以画全局图,即两两变量之间的分布关系。

对角线的分布图,单从各个维度上看,各组的数据都有较大的重叠,即从单一维度上,无法较好的区分数据。

使用LDA算法降维过程:

step1:计算组间方差矩阵B=\sum ^{g}_{k=1}n_{k}(\overline{y}_{k}-\overline{y})'(\overline{y}_{k}-\overline{y})

#租的标签
clusters=np.unique(data['label'])

#组间协方差矩阵
B = np.zeros((data.shape[1]-1,data.shape[1]-1)) #构造一个和原始数据特征维度一样的方阵B
y_hat = data.iloc[:,:-1].mean(0)  #所有样本的平均值
for i in clusters:
    Ni = data[data['label'] == i].iloc[:,:-1].shape[0]  #各个样本的样本数
    ui = data[data['label'] == i].iloc[:,:-1].mean(0)  #某个类别的平均值
    SBi = Ni*np.dot(np.mat(ui - y_hat).T,np.mat(ui - y_hat))
    B += SBi
B

输出:

array([[ 7.82102934e+01, -4.51200260e+02,  7.66358682e+00,
        -4.46707730e+01, -7.10295522e+01],
       [-4.51200260e+02,  2.65873662e+03, -4.31571861e+01,
         2.50295766e+02,  4.89521636e+02],
       [ 7.66358682e+00, -4.31571861e+01,  7.70884752e-01,
        -4.51741260e+00, -5.45103771e+00],
       [-4.46707730e+01,  2.50295766e+02, -4.51741260e+00,
         2.65002117e+01,  2.99625104e+01],
       [-7.10295522e+01,  4.89521636e+02, -5.45103771e+00,
         2.99625104e+01,  1.78617620e+02]])

step2:计算组内方差矩阵W=\sum ^{g}_{k=1}\sum ^{n_{k}}_{i=1}(y_{ki}-\overline{y}_{k})'(y_{ki}-\overline{y}_{k})

#组内协方差矩阵
W = np.zeros((data.shape[1]-1,data.shape[1]-1))  #构造一个和原始数据特征维度一样的方阵W
for i in clusters:
    data_i=data[data['label'] == i]
    data_i=data_i.iloc[:,:-1]
    y_i_hat=data_i.mean(0)     #组内平均值 
    for i in range(data_i.shape[0]): 
        data_i_k = data_i.iloc[i,:]
        Swi = np.dot(np.mat(data_i_k-y_i_hat).T,np.mat(data_i_k-y_i_hat))  
        W += Swi
W

输出:

array([[ 9.19015584e+01,  1.02800260e+02, -2.87254978e+00,
         1.48740260e+00,  3.66821818e+01],
       [ 1.02800260e+02,  1.73134338e+03,  9.67186147e-01,
         6.24842338e+01,  8.55836364e+00],
       [-2.87254978e+00,  9.67186147e-01,  1.43065599e+00,
         2.92030519e+00, -1.33146970e+00],
       [ 1.48740260e+00,  6.24842338e+01,  2.92030519e+00,
         2.45342623e+01,  1.56760636e+01],
       [ 3.66821818e+01,  8.55836364e+00, -1.33146970e+00,
         1.56760636e+01,  1.71479255e+02]])

step3:计算矩阵W^{-1}B

S = np.dot(np.linalg.inv(W),B) 
S

输出:

array([[ 1.82516012e+00, -1.07591870e+01,  1.74495236e-01,
        -1.01190860e+00, -1.98628881e+00],
       [-2.80144016e-01,  1.70631002e+00, -2.57448644e-02,
         1.48018421e-01,  3.83404462e-01],
       [ 1.41480726e+01, -7.79818659e+01,  1.45518636e+00,
        -8.56489218e+00, -7.64169791e+00],
       [-2.62000045e+00,  1.37399432e+01, -2.82742831e-01,
         1.67932992e+00,  4.11969952e-01],
       [-4.41300084e-01,  3.20954366e+00, -3.06844034e-02,
         1.63783970e-01,  1.35039633e+00]])

step4:计算W^{-1}B的特征值\lambda _{1}\lambda _{2},....,\lambda _{s}以及对应的特征向量e_{1}e_{2},...,e_{s}

eigVals,eigVects = np.linalg.eig(S)  #求特征值,特征向量
eigpairs = [(np.abs(eigVals[i]), eigVects[:,i]) for i in range(len(eigVals))]  #将特征值和对应的特征向量绑定成一个元祖。
eigpairs

输出:

[(6.736305722392899,
  array([ 0.12841268+0.j, -0.01991815+0.j,  0.97486544+0.j, -0.17787167+0.j,
         -0.03335415+0.j])),
 (6.245004513516506e-17,
  array([-0.30577419+0.j, -0.01618153+0.j,  0.9340433 +0.j, -0.18296885+0.j,
         -0.01805021+0.j])),
 (1.2800770307908278,
  array([ 0.03545112+0.j, -0.01766616+0.j, -0.93249504+0.j,  0.32884656+0.j,
         -0.14402803+0.j])),
 (3.782695793427638e-16,
  array([ 0.20869023-0.05456166j,  0.02924344-0.02887822j,
          0.93259111+0.j        ,  0.24577484+0.14294114j,
         -0.0099238 +0.03346897j])),
 (3.782695793427638e-16,
  array([ 0.20869023+0.05456166j,  0.02924344+0.02887822j,
          0.93259111-0.j        ,  0.24577484-0.14294114j,
         -0.0099238 -0.03346897j]))]

step5:将特征值\lambda _{1}\lambda _{2},....,\lambda _{s}按照从大到小的顺序排列,选择非零特征值及对应的特征向量(s\leq min(g-1,p)g代表组数,p代表样本数据维度,如原始数据是3个组群,5个维度的数据,则非零特征值最多为2个),注意:非零特征值的意思是抛弃无限接近0的特征值,可通过特征值的占比来筛选特征值。

eigpairs = sorted(eigpairs, key=lambda k: k[0], reverse=True) # 根据特征值降序排序
eigpairs

输出:

[(6.736305722392899,
  array([ 0.12841268+0.j, -0.01991815+0.j,  0.97486544+0.j, -0.17787167+0.j,
         -0.03335415+0.j])),
 (1.2800770307908278,
  array([ 0.03545112+0.j, -0.01766616+0.j, -0.93249504+0.j,  0.32884656+0.j,
         -0.14402803+0.j])),
 (3.782695793427638e-16,
  array([ 0.20869023-0.05456166j,  0.02924344-0.02887822j,
          0.93259111+0.j        ,  0.24577484+0.14294114j,
         -0.0099238 +0.03346897j])),
 (3.782695793427638e-16,
  array([ 0.20869023+0.05456166j,  0.02924344+0.02887822j,
          0.93259111-0.j        ,  0.24577484-0.14294114j,
         -0.0099238 -0.03346897j])),
 (6.245004513516506e-17,
  array([-0.30577419+0.j, -0.01618153+0.j,  0.9340433 +0.j, -0.18296885+0.j,
         -0.01805021+0.j]))]

 计算特征值占比:

# 通过特征值的比例来筛选特征值
for i,j in enumerate(eigpairs):
    print('eigVal%s: %f' %(i+1, (j[0]/eigVals.sum())))

输出:

eigVal1: 0.840317
eigVal2: 0.159683
eigVal3: 0.000000
eigVal4: 0.000000
eigVal5: 0.000000

筛选特征向量组成映射矩阵:

#选择非零特征值对应的特征向量作为映射矩阵Z
Z= np.vstack((eigpairs[0][1], eigpairs[1][1])).T
Z

输出:

array([[ 0.12841268+0.j,  0.03545112+0.j],
       [-0.01991815+0.j, -0.01766616+0.j],
       [ 0.97486544+0.j, -0.93249504+0.j],
       [-0.17787167+0.j,  0.32884656+0.j],
       [-0.03335415+0.j, -0.14402803+0.j]])

step6:将样本Y投影到新的空间Z,即得到了LDA降维后的结果,降维后为2维特征。

data_=np.dot(np.mat(data.iloc[:,:-1]),Z)
data_

输出:

matrix([[-1.98240436+0.j, -0.38325885+0.j],
        [-2.23895967+0.j, -0.24869691+0.j],
        [-1.68704195+0.j, -0.142058  +0.j],
        [-2.13486186+0.j, -0.26578783+0.j],
        [-2.17974478+0.j, -0.03259639+0.j],
        [-1.74667874+0.j, -0.13214131+0.j],
        [-1.55953271+0.j, -0.13844398+0.j],
        [-1.68508356+0.j,  0.72475706+0.j],
        [-1.1974488 +0.j,  0.60711313+0.j],
        [-1.17539724+0.j,  1.19866906+0.j],
        [-0.46583313+0.j,  1.35188424+0.j],
        [-1.50070354+0.j,  1.37555728+0.j],
        [-0.75650544+0.j,  0.6157262 +0.j],
        [-1.31782703+0.j,  0.74866093+0.j],
        [-1.32474307+0.j,  1.14561945+0.j],
        [-1.26497509+0.j,  0.19023476+0.j],
        [-1.816251  +0.j,  0.92796843+0.j],
        [-1.48223369+0.j, -0.29111897+0.j],
        [ 0.00748193+0.j, -0.26936795+0.j],
        [-0.08522769+0.j,  0.23168825+0.j],
        [-0.41231509+0.j,  0.83135552+0.j],
        [ 0.23014115+0.j, -0.0957719 +0.j],
        [ 0.02054684+0.j,  0.06162732+0.j],
        [ 0.48231118+0.j,  0.17544311+0.j],
        [ 0.11349465+0.j,  0.32497595+0.j],
        [-0.11256643+0.j,  0.03207345+0.j],
        [ 0.46192225+0.j, -0.2352691 +0.j]])

 降维后的数据可视化:

data_=pd.DataFrame(data_)
data_['label']=data['label']
plt.scatter(data_[0],data_[1],c=data['label'],cmap='rainbow')

输出:

step7:计算Fisher判别函数:Z={a}'Y={e_{s}}'Y,其中Y根据数据维度可分解为\left [ y_{1},y_{2},...,y_{p} \right ],注意:输出的判别函数即为分类的规则,有多少个特征向量e_{s},就有多少个判别式。 

本案例的降维之后的2维数据,第一维度可用判别式Z_{1}=0.1284y_{1}-0.0199y_{2}+0.9748y_{3}-0.1778y_{4}-0.0333y_{5}表示,第二维度可用判别式Z_{2}= 0.0354y_{1}-0.0176y_{2}-0.9324y_{3} +0.3288y_{4} -0.1440y_{5}表示。

五、LDA与PCA的联系和区别

LDA用于降维,和PCA有很多相同,也有很多不同的地方,因此值得好好的比较一下两者的降维异同点。

1、相同点:

  • 两者均可以对数据进行降维。
  • 两者在降维时均使用了矩阵特征分解的思想。
  • 两者都假设数据符合高斯分布。

2、不同点:

  • LDA是有监督的降维方法,而PCA是无监督的降维方法(可以理解为LDA寻求的是两个或多个群体之间距离最大化的线性组合,而PCA中只有一个群体,目标是找到能使这个群体中个体之间分得最开的变量组合)。
  • LDA降维最多降到类别数k-1的维数,所以当数据维度很高,但是类别数少的时候,算法并不适用。而PCA没有这个限制。
  • LDA除了可以用于降维,还可以用于分类。
  • LDA选择分类性能最好的投影方向,而PCA选择样本点投影具有最大方差的方向。

    这点可以从下图形象的看出,在某些数据分布下LDA比PCA降维较优。

 我们知道:LCA是选组间变异最大的投影方向(可理解为每组均值的变异),而PCA选择样本点投影具有最大方差的方向。如上图左图,均值相隔较远,则LCA降维之后的效果优于PCA;右图,均值相隔很近,则LDA降维之后的效果不如PCA。

3、LDA算法主要优点:

  • 在降维过程中可以使用类别的先验知识经验,而像PCA这样的无监督学习则无法使用类别先验知识。
  • LDA在样本分类信息依赖均值而不是方差的时候,比PCA之类的算法较优。

4、LDA算法主要缺点:

  • LDA不适合对非高斯分布样本进行降维,PCA也有这个问题。
  • LDA降维最多降到类别数k-1的维数,如果我们降维的维度大于k-1,则不能使用LDA。目前有一些LDA的进化版算法可以绕过这个问题。
  • LDA在样本分类信息依赖方差而不是均值的时候,降维效果不好。
  • LDA可能过度拟合数据。

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