ICBatlas数据库-转录组免疫检查点阻断疗法数据-CSDN博客

本文链接：https://blog.csdn.net/hx2024/article/details/136812955

ICBatlas: A Comprehensive Resource for Depicting Immune Checkpoint Blockade Therapy Characteristics from Transcriptome Profiles

介绍：在线ICBatlas (hust.edu.cn)

检查点阻断（ICB）疗法为多种癌症类型提供了显着的临床益处。目前正在进行大量工作来研究转录水平上ICB治疗的机制。整合这些研究产生的数据将有助于我们更深入地了解ICB治疗的转录组学特征。我们从 Gene Expression Omnibus、ArrayExpress、The Cancer Genome Atlas 和 dbGaP 数据库中收集了 ICB 治疗患者样本的转录组和临床数据。根据临床信息，将所有样本初步分为反应组/无反应组或治疗前/治疗中组。在不同组的样品之间进行差异表达、通路富集和免疫细胞浸润分析。我们还介绍了通过整合反应者中失调基因的变异度和频率来计算的反应分数（RS），以评估基因表达对反应的影响。最后，上述所有内容都集成到ICBatlas数据库中。ICBatlas通过分析来自9种癌症类型的25项研究的1,515个ICB处理样本，提供了ICB治疗的转录组特征。ICBatlas中的数据包括临床结果、治疗相关基因、生物通路和免疫细胞浸润。用户可以在数据集、癌症类型或免疫检查点水平上研究反应（R 与 NR）或治疗（Pre vs. On）模块中的上述转录组特征，并在 RS 模块中比较基因对反应的影响程度。ICBatlas是第一个显示ICB治疗人类癌症转录组特征的数据库，可在 ICBatlas 免费获得。