生信脚本练习(7)求fastq文件质量值分布

本文介绍如何使用脚本计算fastq文件中质量值的种类及比例,并提供了通过字典实现的优化解法,最终通过图表展示质量值分布。
摘要由CSDN通过智能技术生成

这里是求fastq文件的质量类型和比例
注意数几种类型用了set() 的方法

with open("Test1.fastq","r") as f:
    lines = f.readlines()
qual = []
for line in lines:
    if lines.index(line)% 4 == 3:
        line= line.strip('\n')
        qual.append(line)
qual = <
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