用Python制作交互式知识图 使用 NetworkX 和 Plotly 创建交互式知识图,并探索不同的布局(教程含源码)

本文介绍了如何使用Python的NetworkX和Plotly库创建交互式的知识图谱。通过定义节点和关系,然后应用不同布局算法如Fruchterman-Reingold、Kamada-Kawai和圆形布局,展示知识图谱的可视化效果。同时探讨了各种布局的适用场景和优缺点,以帮助选择最佳布局策略。

摘要生成于 C知道 ,由 DeepSeek-R1 满血版支持, 前往体验 >

让我们使用 NetworkX 和 Plotly 使其具有交互性。

创建知识图谱

首先,我们定义代表知识图谱中关系的数据。我们有三个列表:head、relation和tail,分别表示起始实体、实体之间的关系和结束实体。我们从定义的列表创建一个数据框,并使用 NetworkX 创建关系的图形表示。

import pandas as pd
import networkx as nx
import plotly.graph_objects as go

# Define the heads, relations, and tails
head = ['drugA', 'drugB', 'drugC', 'drugD', 'drugA', 'drugC', 'drugD', 'drugE', '基因1', '基因2','基因3', '基因4', '基因50', '基因2', '基因3', '基因4']
#relation = ['treats', 'treats', 'treats', 'treats', 'inhibits', 'inhibits', 'inhibits', 'inhibits', 'associated&
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