from distutils.core import setup
from distutils.extension import Extension
from Cython.Distutils import build_ext
import numpy as np
setup(
cmdclass={'build_ext': build_ext},
#ext_modules=cythonize("compute_overlap.pyx"),
ext_modules = [Extension("compute_overlap",["compute_overlap.pyx"])],
include_dirs=[np.get_include()]
)
我从前用过openmp,见从前的博文《简单尝试windows多线程程序》。感觉openmp是神器一个,既方便写程序,又能利用cpu的多个核心,大大提升运行效率。问题是,python中能够使用openmp么?答案是悲观的。python的默认实现是cpython,也就是用c来做的实现,而c的函数大部分都不是线程安全的,为了利用这些函数实现、同时又为了运行时的线程安全,python做了GIL(Global Interpreter Lock)的限制,也就是说,同一段时间内只