pyx编译pyd

本文介绍了如何在Python中利用Cython和OpenMP实现并行计算,通过创建pyx文件编写C扩展,使用prange实现并行循环。详细讲述了安装Cython的过程,以及编写和编译pyx文件生成pyd模块,最后展示了如何在Python脚本中调用这些并行计算功能。
摘要由CSDN通过智能技术生成

 

from distutils.core import setup

from distutils.extension import Extension
from Cython.Distutils import build_ext
import numpy as np

setup(

    cmdclass={'build_ext': build_ext},
    #ext_modules=cythonize("compute_overlap.pyx"),
    ext_modules = [Extension("compute_overlap",["compute_overlap.pyx"])],
    include_dirs=[np.get_include()]
)

我从前用过openmp,见从前的博文《简单尝试windows多线程程序》。感觉openmp是神器一个,既方便写程序,又能利用cpu的多个核心,大大提升运行效率。问题是,python中能够使用openmp么?答案是悲观的。python的默认实现是cpython,也就是用c来做的实现,而c的函数大部分都不是线程安全的,为了利用这些函数实现、同时又为了运行时的线程安全,python做了GIL(Global Interpreter Lock)的限制,也就是说,同一段时间内只

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