【集成学习（下）】Task13 Stacking

基于前面对Blending集成学习算法的讨论，我们知道：Blending在集成的过程中只会用到验证集的数据，对数据实际上是一个很大的浪费。为了解决这个问题，我们详细分析下Blending到底哪里出现问题并如何改进。在Blending中，我们产生验证集的方式是使用分割的方式，产生一组训练集和一组验证集，这让我们联想到交叉验证的方式。顺着这个思路，我们对Stacking进行建模(如下图)：

• 首先将所有数据集生成测试集和训练集（假如训练集为10000,测试集为2500行），那么上层会进行5折交叉检验，使用训练集中的8000条作为训练集，剩余2000行作为验证集（橙色）。
• 每次验证相当于使用了蓝色的8000条数据训练出一个模型，使用模型对验证集进行验证得到2000条数据，并对测试集进行预测，得到2500条数据，这样经过5次交叉检验，可以得到中间的橙色的5* 2000条验证集的结果(相当于每条数据的预测结果)，5* 2500条测试集的预测结果。
• 接下来会将验证集的5* 2000条预测结果拼接成10000行长的矩阵，标记为$A_1$，而对于5* 2500行的测试集的预测结果进行加权平均，得到一个2500一列的矩阵，标记为$B_1$。
• 上面得到一个基模型在数据集上的预测结果$A_1$、$B_1$,这样当我们对3个基模型进行集成的话，相于得到了$A_1$、$A_2$、$A_3$、$B_1$、$B_2$、$B_3$六个矩阵。
• 之后我们会将$A_1$、$A_2$、$A_3$并列在一起成10000行3列的矩阵作为training data,$B_1$、$B_2$、$B_3$合并在一起成2500行3列的矩阵作为testing data，让下层学习器基于这样的数据进行再训练。
• 再训练是基于每个基础模型的预测结果作为特征（三个特征），次学习器会学习训练如果往这样的基学习的预测结果上赋予权重w，来使得最后的预测最为准确。
  下面，我们来实际应用下Stacking是如何集成算法的：(参考案例)
  
  由于sklearn并没有直接对Stacking的方法，因此我们需要下载mlxtend工具包(pip install mlxtend)

# 1. 简单堆叠3折CV分类
from sklearn import datasets

iris = datasets.load_iris()
X,y = iris.data[:,1:3],iris.target
from sklearn.model_selection import cross_val_score
from sklearn.linear_model import LogisticRegression
from sklearn.neighbors import KNeighborsClassifier
from sklearn.naive_bayes import GaussianNB
from sklearn.ensemble import RandomForestClassifier
from mlxtend.classifier import StackingCVClassifier

import matplotlib.pyplot as plt
plt.style.use("ggplot")
%matplotlib inline

RANDOM_SEED = 42

clf1 = KNeighborsClassifier(n_neighbors = 1)
clf2 = RandomForestClassifier(random_state = RANDOM_SEED)
clf3 = GaussianNB()
lr = LogisticRegression()

sclf = StackingCVClassifier(classifiers=[clf1,clf2,clf3],
                            meta_classifier=lr,
                            random_state=RANDOM_SEED)

print('3-fold cross validation: \n')  # 输出3折验证集的结果

for clf,label in zip([clf1,clf2,clf3,sclf],['KNN','Random Forest','Naive Bayes','StackingClassifier']):
    scores = cross_val_score(clf,X,y,cv = 3,scoring = 'accuracy')
    print('Accuraacy: %0.2f (+/- %0.2f) [%s]' % (scores.mean(),scores.std(),label))

3-fold cross validation: 

Accuraacy: 0.91 (+/- 0.01) [KNN]
Accuraacy: 0.95 (+/- 0.01) [Random Forest]
Accuraacy: 0.91 (+/- 0.02) [Naive Bayes]
Accuraacy: 0.93 (+/- 0.02) [StackingClassifier]

clf

StackingCVClassifier(classifiers=[KNeighborsClassifier(n_neighbors=1),
                                  RandomForestClassifier(random_state=42),
                                  GaussianNB()],
                     meta_classifier=LogisticRegression(), random_state=42)

# 我们画出决策边界
from mlxtend.plotting import plot_decision_regions
import matplotlib.gridspec as gridspec
import itertools

gs = gridspec.GridSpec(2,2)
fig = plt.figure(figsize=(10,8))
for clf,lab,grd in zip([clf1,clf2,clf3,sclf],
                       ['KNN',
                        'Random Forest',
                        'Naive Bayes',
                        'StackingCVClassifer'],
                        itertools.product([0,1],repeat=2)):
    clf.fit(X,y)
    ax = plt.subplot(gs[grd[0],grd[1]])
    fig = plot_decision_regions(X=X,y=y,clf=clf)  # 绘制决策区域!
    plt.title(lab)
plt.show()

使用第一层所有基分类器所产生的类别概率值作为meta-classfier的输入。需要在StackingClassifier 中增加一个参数设置：use_probas = True。

另外，还有一个参数设置average_probas = True,那么这些基分类器所产出的概率值将按照列被平均，否则会拼接。

例如：

基分类器1：predictions=[0.2,0.2,0.7]

基分类器2：predictions=[0.4,0.3,0.8]

基分类器3：predictions=[0.1,0.4,0.6]

1）若use_probas = True，average_probas = True，

则产生的meta-feature 为：[0.233, 0.3, 0.7]

2）若use_probas = True，average_probas = False，

则产生的meta-feature 为：[0.2,0.2,0.7,0.4,0.3,0.8,0.1,0.4,0.6]

# 2.使用概率作为元特征
clf1 = KNeighborsClassifier(n_neighbors=1)
clf2 = RandomForestClassifier(random_state=1)
clf3 = GaussianNB()
lr = LogisticRegression()

sclf = StackingCVClassifier(classifiers=[clf1, clf2, clf3],
                            use_probas=True,  # 
                            meta_classifier=lr,
                            random_state=42)

print('3-fold cross validation:\n')

for clf, label in zip([clf1, clf2, clf3, sclf], 
                      ['KNN', 
                       'Random Forest', 
                       'Naive Bayes',
                       'StackingClassifier']):

    scores = cross_val_score(clf, X, y, 
                                              cv=3, scoring='accuracy')
    print("Accuracy: %0.2f (+/- %0.2f) [%s]" 
          % (scores.mean(), scores.std(), label))

3-fold cross validation:

Accuracy: 0.91 (+/- 0.01) [KNN]
Accuracy: 0.95 (+/- 0.01) [Random Forest]
Accuracy: 0.91 (+/- 0.02) [Naive Bayes]
Accuracy: 0.95 (+/- 0.02) [StackingClassifier]

# 3 堆叠5折CV分类与网格搜索(结合网格搜索调参优化)
from sklearn.linear_model import LogisticRegression
from sklearn.neighbors import KNeighborsClassifier
from sklearn.naive_bayes import GaussianNB 
from sklearn.ensemble import RandomForestClassifier
from sklearn.model_selection import GridSearchCV
from mlxtend.classifier import StackingCVClassifier
# Initializing models 模型初始化

clf1 = KNeighborsClassifier(n_neighbors=1)
clf2 = RandomForestClassifier(random_state=RANDOM_SEED)
clf3 = GaussianNB()
lr = LogisticRegression()

sclf = StackingCVClassifier(classifiers=[clf1, clf2, clf3], 
                            meta_classifier=lr,
                            random_state=42)

params = StackingCVClassifier(classifiers = [clf1,clf2,clf3],
                              meta_classifier = lr,
                              random_state = 42)

params = {'kneighborsclassifier__n_neighbors': [1, 5],
          'randomforestclassifier__n_estimators': [10, 50],
          'meta_classifier__C': [0.1, 10.0]}

grid = GridSearchCV(estimator=sclf, 
                    param_grid=params, 
                    cv=5,
                    refit=True)
grid.fit(X,y)

cv_keys = ('mean_test_score','std_test_score','params')

for r, _ in enumerate(grid.cv_results_['mean_test_score']):
    print("%0.3f +/- %0.2f %r"
          % (grid.cv_results_[cv_keys[0]][r],
             grid.cv_results_[cv_keys[1]][r] / 2.0,
             grid.cv_results_[cv_keys[2]][r]))  # 

print('Best parameters: %s' % grid.best_params_)
print('Accuracy: %.2f' % grid.best_score_)

0.947 +/- 0.03 {'kneighborsclassifier__n_neighbors': 1, 'meta_classifier__C': 0.1, 'randomforestclassifier__n_estimators': 10}
0.933 +/- 0.02 {'kneighborsclassifier__n_neighbors': 1, 'meta_classifier__C': 0.1, 'randomforestclassifier__n_estimators': 50}
0.940 +/- 0.02 {'kneighborsclassifier__n_neighbors': 1, 'meta_classifier__C': 10.0, 'randomforestclassifier__n_estimators': 10}
0.940 +/- 0.02 {'kneighborsclassifier__n_neighbors': 1, 'meta_classifier__C': 10.0, 'randomforestclassifier__n_estimators': 50}
0.953 +/- 0.02 {'kneighborsclassifier__n_neighbors': 5, 'meta_classifier__C': 0.1, 'randomforestclassifier__n_estimators': 10}
0.953 +/- 0.02 {'kneighborsclassifier__n_neighbors': 5, 'meta_classifier__C': 0.1, 'randomforestclassifier__n_estimators': 50}
0.953 +/- 0.02 {'kneighborsclassifier__n_neighbors': 5, 'meta_classifier__C': 10.0, 'randomforestclassifier__n_estimators': 10}
0.953 +/- 0.02 {'kneighborsclassifier__n_neighbors': 5, 'meta_classifier__C': 10.0, 'randomforestclassifier__n_estimators': 50}
Best parameters: {'kneighborsclassifier__n_neighbors': 5, 'meta_classifier__C': 0.1, 'randomforestclassifier__n_estimators': 10}
Accuracy: 0.95

grid.cv_results_[cv_keys[0]]

array([0.94666667, 0.93333333, 0.94      , 0.94      , 0.95333333,
       0.95333333, 0.95333333, 0.95333333])

总结

1> Stacking 也有包可以用,mlxtend 用里面的StackingCVClassifier