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原创 使用NCBI rpsblast寻找蛋白序列具有的保守Domain (本地版CD-search)

在生信研究中经常需要寻找蛋白序列的Domain,蛋白序列的Domain对于蛋白质来说是最重要的一部分。网页版CD-search能够解决少量蛋白序列的搜索需求,但是若是需要寻找大量的蛋白Domain信息,那么NCBI-blast+安装包携带的rpsblast绝对是最好的选择。

2020-09-26 20:55:32 8196

原创 使用concurrent.futures模块快捷方便的进行多线程(池)或多进程(池)操作(python)

本文从ThreadPoolExecutor 入手介绍了concurrent.futures模块的使用方式,内容包含了future对象、submit方法、map方法,as_completed、wait方法的使用方法。希望能帮到大家!

2020-09-20 17:55:41 886

原创 python多进程multiprocessing包中queue、pipe、manager模块的功能介绍(超易懂哦!)

python多进程主要用于解决python自身含有的GIL(即全局解释器锁)所导致的不能并行任务的问题,之前已经介绍了multiprocessing包的基本使用方式,本文简要介绍一下multiprocessing包中含有的几个模块pipe(管道)、queue(队列)、manager,这几个模块在某些较为复杂的实际应用中还是很有用处的。

2020-09-19 20:58:33 4951

原创 python多进程模块(multiprocessing)的基本使用方法(想要轻松上手的不要错过啦!)

python多线程由于具有全局解释器锁,因此python多线程并不能够真正运用上多核CPU全部能力。使用多进程就是python提供的解决办法,本文简要介绍了multiprocessing模块的多进程使用方法,为入门级教学,用于平时任务中应该已经足够啦!

2020-09-12 13:28:18 2465

原创 同步异步、串行并行并发、阻塞非阻塞、进程线程协程概念的简单理解及区分

本文简要解释了同步异步、串行并行并发、阻塞非阻塞、进程线程协程概念的的概念的区分。

2020-09-09 22:28:39 273

原创 (python) 多线程和多进程中的join方法的用处

python多线程与多进程是加快程序速度必用的模块,在这两个模块中都有进程或线程各自的join方法,本文简要介绍了一下join方法的作用,希望能帮助到大家。

2020-09-06 18:12:23 792

原创 入门R语言(2):变量、运算符、决策、循环、函数、字符串的基础方法

R语言是一门很适合数据分析、绘图的一门语言,在当今数据分析领域中占据很重要的位置,本文简要介绍了R语言基础内容如变量、运算符、决策等。希望能帮助大家入门,本文参考编程狮网站https://www.w3cschool.cn/r/进行整理,亦可直接进此网站学习。

2020-09-04 23:23:01 586

psi-cd-hit脚本

psi-cd-hit用于低于40%相似性的序列聚类,是直接从github上拷贝过来的代码哈,大家也可以直接去github上下载就行。

2021-01-06

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