Rosetta 蛋白抗体设计有困难？小白速看

最新推荐文章于 2024-06-14 02:02:23 发布
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文章标签： python 算法
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以Rosetta软件为基础，以实例讲授和练习为主。依次讲授Rosetta软件基础、蛋白质结构viewer、结构扰动与结构优化、Linux和Python基础、蛋白质复合物预测、抗体抗原模型处理与对接、SSD和MSD设计、 CartisenDDG 突变扫描、RosettaScript开发流程、序列与结构设计、从头蛋白质设计等的操作等多个内容。 

 

 另有计算机辅助药物设计CADD专题及机器学习多组学专题。

计算机辅助药物设计、rosetta 蛋白抗体设计、机器学习集成多组学系列专题2023

kuriovo
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Rosetta从头蛋白抗体设计、结构优化及在药物研发中的应用
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因此，优化蛋白质的稳定性是科学研究与工程应用领域亟待解决的关键问题。Rosetta是一种生物物理建模工具，根据蛋白质的氨基酸序列有效预测蛋白质的结构，在此基础上可以从头设计各种类型的全新蛋白质。教学目标：了解Rosetta封装好的应用（以relax为例）和RosettaScript编写应用（以pack/min/pack为例）。教学目标：熟悉RosettaScript开发流程，了解序列与结构设计原理，完成从头蛋白质设计的操作练习。教学目标：了解基于序列和基于结构的蛋白质复合物预测手段。
Rosetta入门指南
Rubyhouse的博客
04-25 165
Rosetta入门指南 | 机器学习集成多组学、Rosetta从头蛋白抗体设计、计算机辅助药物设计。专题三：CADD蛋白结构分析、虚拟筛选、分子对接（蛋白-蛋白、蛋白-多肽）专题二：Rosetta从头蛋白抗体设计、结构优化及在药物研发中的应用专题。专题一：集成多组学数据的机器学习在生物医学中的应用专题。
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04-27 172
Rosetta 是一种生物物理建模工具， 根据蛋白质的氨基酸序列有效预测蛋白质的结构，在此基础上可以从头设计各种类型的全新蛋白质。 基于 Rosetta 系列算法的蛋白设计在过去十年中在创新蛋白药物、抗体、疫苗、新型合成生物学元件及纳米药物等生物大分子研究领域中被广泛使用。
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Rosetta Rosetta概览 Rosetta软件包括用于蛋白质结构的计算建模和分析的算法。它使计算生物学取得了显着的科学进步，包括从头进行蛋白质设计，酶设计，分子对接以及生物大分子和大分子复合物的结构预测。 所有非商业用户均可免费使用Rosetta，商业用户可付费使用Rosetta。 Rosetta的开发始于华盛顿大学David Baker博士的实验室，作为结构预测工具，但从...
Mac系统如何安装rosetta？
你白勺男孩TT的博客
12-28 3522
Rosetta是什么？如何安装？如何使用？
【生物医药领域专题--Rosetta 蛋白抗体设计】
y2715163545的博客
04-03 197
Rosetta 是一种生物物理建模工具，根据蛋白质的氨基酸序列有效预测蛋白质的结构，在此基础上可以从头设计各种类型的全新蛋白质。依次讲授 Rosetta 软件基础、蛋白质结构 viewer、结构扰动与结构优化、蛋白质复合物预测、抗体抗原模型处理与对接、SSD 和 MSD 设计、CartisenDDG 突变扫描、RosettaScript 开发流程、序列与结构设计、从头蛋白质设计等的操作等多个内容。教学目标：了解基于序列和基于结构的蛋白质复合物预测手段。教学目标：了解本方向内容、理论基础、研究意义。
Science | 华盛顿大学利用AI和结构预测设计全新蛋白质
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今天给大家介绍的是麻省理工大学计算机科学和人工智能实验室在NeuIPS 2019会议上发表的一篇文章。在文中，作者提出了一种基于图结构的蛋白质序列生成模型，通过聚焦三维空间上相邻的蛋白质...
AI-蛋白质-序列设计-从头设计-基于结构(Structure)-2015：Rosetta、SCUBA【从头设计理想形状的蛋白，还不能设计具有催化功能的蛋白】
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此 repo 中的脚本 罗塞塔 default.enzdes.flags 贾斯汀·西格尔 用于 RosettaScripts 的默认标志文件。 submit.bash 用于 Epiphany 的高性能提交脚本。 用于处理 PDB 文件的脚本 pdb_parser.py ...
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使用来自PconsC的预测接触和Rosetta折叠协议进行蛋白质折叠的管道。 您可以在底部找到补充数据，例如蛋白质ID，序列，天然和预测的结构，预测的联系方式。 管道概述： 输入：包含一个蛋白质序列的fasta文件 准备...
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