13. Lammps入门in文件简介-1

来源： “码农不会写诗”公众号
链接：Lammps入门in文件简介-1

书回正文

  Lammps通过一次一行地从输入脚本（文本文件，通常称in文件）中读取命令来执行计算，当输入脚本结束时，Lammps退出。掌握in文件语法和解析规则可以有效快速的设置和获取感兴趣的模拟信息，往往事半功倍。

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01 in文件简介

Lammps从in文件读取命令从而执行指定计算，注意是一次一行的读取然后执行，并不会一次性读取整个in文件，也就是说若某行有错误，直到执行到相应行才会报出相关错误。每个命令都会使Lammps立即采取行动，而不考虑以后可能处理的任何命令。

02 in文件命令解析规则

https://docs.lammps.org/Commands_input.html

in文件中每个非空行都被视为一个命令，命令区分大小写。一般的，命令名和指定的命令参数都是小写；文件名或用户选择的ID字符串可以使用大写字母（也建议使用大写以作区分）。以下六规则请欣赏。
规则1-跨行符&
如果该行最后一个字符是“&”字符，则该命令将在下一行继续执行，也就是此行和下一行视作同一条命令，这就允许长命令可以用两行或多行的方式书写。当然通过删除“&”字符和换行符，可以将其写在同一行。

timestep  &
1.0

等价于

timestep 1.0

规则2-注释符#
从第一个“#”字符开始的所有字符都将被视为注释。

# 这里是注释
timestep  1.0   # 这里是注释

规则3-变量替换符$

搜索并用变量值替换$字符后的文本字符串。

1. $后面跟大括号“{}”，则变量名就是大括号内的文本字符
2. $后面没有跟大括号“{}”，则变量名是紧跟在$后面的单个字符
   注意：${myTemp}和$x指的是名为“myTemp”和“x”的变量，而“$xx”将被解释为名为“x”、后跟“x”字符的变量。
3. $后面跟括号“()”，则括号内的文本将被视为“立即数”变量，并作为相等样式变量进行计算

variable X equal (xlo+xhi)/2+sqrt(v_area)  # define X
region 1 block $X 2 INF INF EDGE EDGE
variable X delete                          # discard X

等价于

region 1 block $((xlo+xhi)/2+sqrt(v_area)) 2 INF INF EDGE EDGE

4. “立即数”变量表达式后面可以跟冒号":"，然后跟C样式的格式字符串，例如“:%f”或“:%.10g”，该格式字符串用于输出变量表达式的结果。若未指定格式字符串，则使用高精度的“%.20g”作为默认格式。

print "Final energy per atom: $(v_ke_per_atom+v_pe_per_atom:%10.3f) eV/atom"

规则4-命令行分隔符
命令行被分成用空格（制表符、多个空格）分隔的“单词”，单词可以包含字母、数字、下划线或标点符号。
规则5-命令行内容规则
第一个单词是命令名，行中所有后续单词都是参数。
规则6-命令参数带空格
如果希望将带空格（制表符、多个空格）的文本视为单个参数，则可以将其括在单（’）、双（”）或三（”””）引号中，另外如果使用了“&”字符，则用引号括起来的单个长参数可以跨多行。

print "Volume = $v"
print 'Volume = $v'
if "${steps} > 1000" then quit
variable a string "red green blue &
                purple orange cyan"
print """
System volume = $v
System temperature = $t
"""

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本文介绍了in文件的基本规则，之后会逐步讲解in文件结构及常用命令。今天就到这里啦，拜了个拜~

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