文献若只如初见-W1

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01

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来自于Betzel组,用的HPC的数据。作者提出了基于edge的多模态网络整合方法。每个edge上不同模态的信息作为feature,计算几个模态之间的covariance。

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在随后使用了聚类方法进行了进一步的分析。

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a 不同模态的FC

b edge的特征矩阵,为了好看作者使用之后的cluster对其进行了排序。

c 基于b得到的协方差矩阵,同样使用cluster进行排序

d cluster的连接图,使用了force-directed的layout。印象中,做这个图还有spring layout或者circle的layout可以选择。如何选择cluster的个数(k=6)是值得借鉴的地方,他们用的指标是z-score Rand index

e 每个cluster在不同模态的值,所谓connectional fingreprints。

g 每个cluster的modularity

f和h没看原文还不知道是什么指标~

02

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学业成就就反映的就是认知能力(比如智商)?亲身经历证明,智商不够,努力来凑! 

GWAS学业成就:和学业成就相关的基因(n=1,131,881)

GWAS认知能力:和认知能力相关的基因 (n=257,841)

GWAS学业成就-GWAS认知能力=非认知能力相关基因

文章使用的是一个genetic版本的SEM,并提供了详细的教程

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设计比较巧妙,使用了非认知能力概括了所有无法不能被认知能力解释的部分。 后续的分析用了两种思路: 1. phenotypic annotation,看这部分非认知能力的基因和其他的特质比如寿命,决策偏好,社会/职业能力水平等的相关。2. enrichment,看这部分基因和那些组织结构,细胞类型,大脑结构相关,文章值得研读,分析代码已共享在github。 

分享另外一家快递投递的内容,快递员效率很高~

03

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Shrinkage三部曲的第一部,文章的highlight就是下图,1976年到2019年,超过100万个z值的分布,完美诠释publication bias/winner's curse/significance filter。

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看完决定

我的人生目标

便是是填补

中间那一部分空白

04

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fMRI+PET, 81个被试,使用了probabilistic map learning task研究纹状体对reward的反应,使用RAC标记D2/3受体研究DA release,为DA在基于奖赏学习中的作用提供了相对直接的证据。研究的思路和结果堪称neat~

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A. 基线RAC BPnd    

B. task-related DA release

Learner vs. Non-learners 有差异

C. BOLD response

Learner vs. Non-learners 无差异

表明:

  • This learning response was specific to the ventral striatum and was not present in fMRI BOLD reward response activation.

  • The dopaminergic function may support reward reactivity as well as reward learning as distinct processes.

有意思的是DA的release和计算模型中的learning rate相关!

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05

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2020年12月发表在Developmental Cognitive Neuroscience上的文章,用的是ABCD的9-10岁数据,使用了Rest/MID/SST/FACE的磁共振数据预测了substance use的易感性。文章使用了PCA对行为数据进行了降维,使用Rest/MID/SST/n-back的功能连接+CPM做预测。个人认为这个杂志IF要涨,值得关注。

Highlight:

  • PCA降维行为数据

  • 使用了Rest/MID/SST/n-back 功能连接

  •  CPM

  • ABCD N=9,437

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文献若只如初见,整理泛读(extensive reading)的文章。希望读者可以通过2-3分钟的阅读了解一些新的进展。内容难以面面俱到,一切以原文为准。主要关注的领域有

  • addiction

  • adolescents

  • neural development

  • functional connectivity

  • genetics

那么

Intensive reading的标题会是什么?

可以留言你的idea

也许就采纳了呢

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懒麻蛇~

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