预训练环境变量设置
#linux中设置环境变量
export KMER=6
export TRAIN_FILE=sample_data/pre/6_3k.txt
export TEST_FILE=sample_data/pre/6_3k.txt
export SOURCE=PATH_TO_DNABERT_REPO
export OUTPUT_PATH=output$KMER
#cmd中设置环境变量(与上述指令效果等效)
set KMER=6
set TRAIN_FILE=sample_data\pre\6_3k.txt
set TEST_FILE=sample_data\pre\6_3k.txt
set SOURCE=PATH_TO_DNABERT_REPO
set OUTPUT_PATH=output%KMER%
这里的PATH_TO_DNABERT_REPO应该替换为DNABERT仓库的实际路径,我的路径为E:\code\gitcode\DNABERT
预训练运行python脚本