基因组学分析在得到差异表达基因之后,最常做的还是富集分析。通过富集分析我们可以了解相关基因集主要在形式的功能是什么。目前用来做基因富集分析的工具很多。这次介绍的这个叫g:profiler(地址见文末);
G:profiler 不止是可以进行富集分析。这个网站包括四个主要的工具:
-
g:GOSt: 对基因集进行富集分析
-
g:Convert: 基因ID转换工具
-
g:Orth: 不同物种之间同源基因名转换
-
g:SNPense: SNP注释工具
g:GOSt:富集分析
g:GOSt是一个可以进行富集分析的工具。它可以接受多种多样的输入方式。其中包括:geneid; SNPIDs; 染色体位置;GOterms。另外值得注意的是。它可以接受不同类型的输入。比如输入geneids + 染色体位置 + SNPids。