RBPsuite RNA-蛋白质结合位点预测工具使用指南

RNA结合蛋白（RBP）在各种生物学过程中都起着至关重要的作用，它们在RNA上的结合位点可以深入了解涉及RBPs的疾病背后的机制。因此，如何识别RNA上的RBP结合位点对于后续分析至关重要。今天，小编就给大家介绍一种基于深度学习的RNA-蛋白质结合位点预测的网站：RBPsuite，这是一个易于使用的网络服务器，用于预测线性和环形RNA上的RBP结合位点。

RBPsuite首先将输入的RNA序列分割为101个核苷酸的片段，并对片段与RBP之间的相互作用进行评分。RBPsuite进一步检测结合片段上已验证的基序，从而给出沿全长序列的结合得分分布。对于线性RNA，RBPsuite使用iDeepS来预测它们与RBP的结合分数；对于环状RNA（circRNA），RBPsuite使用CRIP预测它们与RBP的结合分数。

话不多说，主页面如下。

RBPsuite需要三种类型的输入：RNA类型，预测模型和RNA序列。电子邮件地址是可选的。如果提供了电子邮件，则作业完成后将向该电子邮件发送通知。

Step 1. 选择 RNA类型

 

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