分子克隆科研利器SnapGene，测序验证好帮手

首先需要下载软件（文末下载），然后安装，打开软件后的界面如下：

 

 

 

01

创建DNA文件

 

可以点击New DNA File输入自己从数据库上下载的序列，或测序得到的系列，对于质粒，Topology选择circular（环形），

勾选Detect common features，将一些质粒共有的常见的特征加入其中，也可以输入蛋白序列(New Protein File)，或是点击Import from Genebank，输入NCBI中某序列的access number，点击OK。以NCBI上大肠杆菌为例，输入NC_000913，便可以得到细菌的完成图，此时弹出如下窗口：

图1

 

从该图可以看到细菌的基因组大小为4,641,652bp,即4.6Mb左右，通过该图，直观的给我们展示了细菌基因组大小

 

 

 

02

软件界面窗口介绍

 

以图1窗口为例，左下角视窗放大如下

图1是在map视窗下的显示界面，选择sequence视窗，可以得到详细的碱基序列信息，结果如下

图2

 

 

前面讲到对于质粒，选择环状，勾选Detect common features，一些质粒共有的常见特征会在软件中展示出来，图2导入NCBI中细菌基因组数据后，细菌基因组中常见的特征也展示出来了，从图中可以直观的看到红紫色标签就是该菌编码的一个蛋白序列，从起始密码子到终止密码子。

 

 选择Enzymes,可以看到该菌含有的所有酶切位点，该图中没有限制性酶切位点，都是多酶切位点(红色箭头标出)

 

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来源：51xxziyuan.com