在进行Amber GPU分子动力学模拟时遇到'cudaMemcpy GpuBuffer::Download failed an illegal memory access was encountered'的错误。通过检查体系结构、软件版本、模拟条件，并尝试修改ntpr、ntwx、ntwr参数以及应用Amber补丁，成功解决了问题。此解决方案可能需要根据不同的设备和体系进行调整。
AMBER分子动力学模拟的一个GpuBuffer错误
在用GPU算Amber分子动力学模拟的时候总是遇到一个错误
cudaMemcpy GpuBuffer::Download failed an illegal memory access was encountered
cudaMemcpy GpuBuffer::Download failed an illegal memory access was encountered
查找了很多资料，发现丢出这个错误并不给出任何有用的信息，需要进一步去检查你的体系、结构是否存在问题。这里，我给出一个解决这个问题的尝试，不一定适用于你的体系、设备，可能需要再多次尝试。
设备、软件版本、模拟条件
（1）GPU设备
V100/16 GB、RTX3080/12 GB、RTX3080Ti/12 GB，不管是在集群还是工作站上都出现过这个问题。
所有机器均为内网，不能连接外网。
（2）软件版本
Amber20、AmberTools21或AmberTools20均出现过这个问题。
（3）模拟体系及条件
膜蛋白，约2000个残基、总原子数约40万（TIP3P水）。使用的力场包括ff19SB、ff14SB、TIP3P、OPC、Gaff、Gaff2、phosaa19、lipid17、GAMCLY-06j_1等。cutoff = 12 ，ntpr = 50000，ntwx = 50000， ntwr = 500000。
报错状态
在minimization、heat的时候均未出现该问题。在equilibrium和producti
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